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发布乳腺癌发生和发展的基因网络相互作用
在《GEN Biotechnology》上发表的一项题为“乳腺癌发病和发展中基因网络相互作用的变化”的新研究中，佐治亚理工学院的研究人员发现了三种最常见的乳腺癌分子亚型——Luminal a、Luminal B和高度转移的基底样亚型——的差异基因网络变化特征。与之前的研究相反，作者将他们的分析扩展到正常和癌症样本之间的基因差异表达之外，因为差异基因表达可能不是基因相互作用变化的先决条件。确定具有临床意义的靶点仍然是癌症基因治疗的关键。虽然癌症被认为是一种多基因疾病，但精确的癌症治疗往往局限于被确定为“癌症驱动因素”的单个基因靶点。因此，癌症发生和发展的重要调控变化可能未被发现，因为基因相互作用
来源：GEN Biotechnology
时间：2024-04-22
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肥胖引起的认知能力下降：脑氧化和生育三烯醇的作用
肥胖已成为一个紧迫的全球健康问题，近几十年来肥胖率稳步上升。除了与心血管疾病和糖尿病等身体健康问题有充分的联系外，肥胖还与认知能力下降有关，包括阿尔茨海默病和帕金森病等疾病。了解这种认知障碍背后的复杂机制对于制定有效的干预措施至关重要。在最近于2024年3月21日在线发表在《国际分子科学杂志》上的一项研究中，鸟取大学和柴浦工业大学的助理教授Yugo Kato，以及柴浦工业大学的Koji Fukui教授及其团队，提供了对潜在解决方案的见解。本研究探讨了生育三烯醇(T3s)在减轻饮食引起的肥胖对脑功能的不利影响方面的神经保护作用。加藤教授说:“我们的目标是使用天然化合物来对抗与肥胖相关的疾病，从而
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研究人员正在解开细胞分裂的一个小谜团
当单个细菌细胞在快速生长期间分裂成两个时，一旦达到预定的大小，它就不会分裂成两半。相反，数据显示，细胞一旦增加了一定数量的质量就会分裂。这两个过程听起来很相似，但它们各自承担着不同的风险。许多研究人员认为，细胞达到一定大小后分裂是更安全的选择。然而，来自肯尼斯·p·迪特里希艺术与科学学院的新数学模型表明，风险可能被错误地计算了，因为之前的计算忽略了分子尺度上细胞分裂的驱动因素。他们的研究结果发表在《物理评论快报》杂志上。“试图在分裂前达到目标大小似乎是保持精确细胞大小的最佳策略，”物理与天文学系副教授安德鲁·穆勒说。“但当你观察细菌的行为时，你会发现它们似乎采用了次优策略。”每次细胞达到一个目
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尿液检测对前列腺癌的诊断准确性更高
根据4月18日发表在《JAMA Oncology》上的一项研究，一种新的尿液检测可以测量18种与前列腺癌相关的基因，在检测临床重要癌症方面比PSA和其他现有的生物标志物检测更准确。研究人员总结说，尿液检测myprostatcore 2.0 (MPS2)被证明可以有效减少不必要的前列腺活检，同时对令人担忧的前列腺癌提供高度准确的检测。“在近800名PSA水平升高的患者中，这项新测试能够以惊人的准确性排除临床显著前列腺癌的存在。这项研究的第一作者、范德比尔特大学医学中心泌尿学助理教授兼转化癌症研究主任Jeffrey Tosoian医学博士说:“这使患者可以避免更繁琐和侵入性的检查，如MRI和前列腺
来源：JAMA Oncology
时间：2024-04-22
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令人惊讶！非编码DNA区域的突变变得有功能，改变mRNA的丰度，引发癌症
研究摘要：尽管在定义非编码DNA的功能元素方面取得了进展，但人们对它的了解仍不全面。加州大学洛杉矶分校的研究人员通过一项实验，阐明了数以万计的非编码变异的功能，发现了功能突变和与癌症途径相关的基因之间的联系，以及预测癌症患者生存的指标。了解突变对mRNA和蛋白质产生的影响可以揭示驱动癌症进展的过程，并指导测试工具的进步。已知一些基因会导致癌症，令人惊讶的新研究揭示了原因:非编码区域的突变变得有功能，改变信使RNA或mRNA的丰度，并可能促进细胞增殖。更令人惊讶的是，这些区域的突变数量可以预测某些类型癌症患者的生存时间。大多数基因都是一段DNA序列，掌握着产生蛋白质的配方。反过来，蛋白质是氨基酸
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研究发现43种可能导致创伤后应激障碍(PTSD)的基因
创伤后应激障碍(PTSD)遗传学的特点是比大多数其他精神疾病更难有所发现。加州大学圣地亚哥分校的研究人员在一项涉及对1,222,882名欧洲血统个体（其中137,136例病患）、58,051名非洲和美洲原住民血统混合个体(其中13,624例病患)的全基因组关联研究进行了多祖先荟萃分析，确定了95个与患创伤后应激障碍(PTSD)风险相关的基因位点，其中包括80个新的基因位点。趋同多组学方法确定了43个潜在的致病基因，大致分为神经递质和离子通道突触调节剂(如GRIA1、GRM8和CACNA1E)、发育、轴突引导和转录因子(如FOXP2、EFNA5和DCC)、突触结构和功能基因(如PCLO、NCAM
来源：Genenews
时间：2024-04-20
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人工智能PERCEPTION：利用肿瘤单细胞分析预测对癌症治疗的反应
症有200多种，每种癌症都是独特的，开发精确肿瘤治疗的持续努力仍然令人望而生畏。大部分的焦点都集中在开发基因测序测定或分析，以识别癌症驱动基因的突变，然后尝试匹配可能对抗这些突变的治疗方法。仍有许多癌症患者无法从这些早期的靶向治疗中获益。在2024年4月18日发表在《Nature Cancer》杂志上的一项新研究中，美国国家癌症研究所的Sanju Sinha博士，以及美国国立卫生研究院(NIH)的科学家们描述了一种史无前例的计算途径，可以在单细胞分辨率下系统地预测患者对癌症药物的反应。这种新的基于人工智能的方法被称为基于个性化单细胞表达的肿瘤治疗计划——PERCEPTION，它更深入地研究了转
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RNA隐藏的潜力：新的研究揭示了它在早期生命和未来生物工程中的作用
地球上生命的起源及其数十亿年的进化一直吸引着全世界的研究人员。遗传信息从脱氧核糖核酸(DNA)模板到核糖核酸(RNA)转录物，并最终进入功能蛋白的中心规律或定向流动是细胞结构和功能的基础。DNA是细胞的蓝图，携带合成功能性蛋白质所需的遗传信息。相反，蛋白质是DNA合成所必需的。因此，究竟是DNA先出现，还是蛋白质先出现，仍然是一个有争议的问题。这种分子版的“先有鸡还是先有蛋”的问题引出了“RNA世界”的命题。RNA以“核酶”或RNA酶的形式携带着与DNA相似的遗传信息，也像蛋白质一样具有催化功能。核酶的发现进一步支持了RNA世界假说，即RNA具有“遗传信息存储”和“催化”的双重功能，仅通过RN
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“对所有病毒变种都有效”的RNAi疫苗策略？！加州大学通用RNAi疫苗增强人体对病毒的RNAi反应
加州大学河滨分校的科学家们开发出一种新的基于RNAi的疫苗策略，可以有效地对抗任何一种病毒，甚至可以安全地用于婴儿或免疫功能低下的人。新策略或许将消除“每年为流感或SARS-CoV-2等病毒研制疫苗”的需要，因为它针对的是所有病毒株共有的病毒基因组的一部分。“关于这种疫苗策略，我想强调的是它是广泛的，”加州大学河滨分校的病毒学家Rong Hai博士说。“它广泛适用于任何数量的病毒，对任何病毒变种都广泛有效，对广泛的人群都是安全的。”这可能是我们一直在寻找的通用疫苗。”Hai和他的同事在《美国国家科学院院刊》上发表了一篇题为《抑制RNAi缺陷的减毒活病毒疫苗在缺乏成熟B细胞和T细胞的新生和成年小
来源：Genengnews
时间：2024-04-19
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《Cell》糖酵解副产物MGO可暂停BRCA2抑癌作用诱导癌症相关突变 糖尿病和不良饮食与癌症关联
• 甲基乙二醛 (MGO) 在单等位基因BRCA2突变细胞中引发全基因组 SBS 突变• MGO 暂时失活 BRCA2 功能，绕过 Knudson 的“双重失活”要求• 通过糖酵解增加 MGO 的致癌或代谢变化会引发类似事件• 这种机制将代谢重编程、代谢紊乱或饮食与癌症发生联系起来甲基乙二醛是糖酵解的副产物，是 3-磷酸甘油醛 (G3P) 和磷酸二羟丙酮 (DHAP) 非酶降解形成的糖酵解产物。超过 90% 的细胞内 MGO 来自糖酵解。高血糖引起的 MGO 升高与 2 型糖尿病的病理有因果关系。BRCA2参与DNA损伤修复和复制，其突变与乳腺癌
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Nature：不同以往的一类新抗菌剂
研究人员发现了一种形状像雨伞的有毒蛋白质颗粒，这种被称为链霉菌（Streptomyces）的土壤细菌分泌这种颗粒来压制竞争对手，尤其是它们自己物种的其他细菌。4月17日，研究人员在《自然》（Nature）杂志上发表了关于伞状毒素颗粒的发现及其结构、组成和作用方式的相关信息。伞状毒素蛋白是这些细菌对其微观对手进行各种战斗攻击的最新例子。它们所生活的拥挤而多样的细菌群落是一场抗菌素攻击、反击和防御的混战。具有讽刺意味的是，许多临床使用的抗生素直接来源于细菌在其自然栖息地中相互对抗的分子，或者受到分子的启发。链霉菌对抗竞争对手的化学武器是这类分子最丰富的来源之一。其中包括常见的广谱药物链霉素。这些新
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Nature子刊发现一种以前未知的机制：人类DNA通过核变态修复
多伦多大学(University of Toronto)的研究人员发现了一种DNA修复机制，有助于进一步了解人类细胞是如何保持健康的，这可能会带来治疗癌症和早衰的新方法。这项发表在《自然结构与分子生物学》杂志上的研究也揭示了一些现有化疗药物的作用机制。“我们认为这项研究解决了人类细胞中DNA双链断裂和核膜连接修复的奥秘，”该研究的联合首席研究员、多伦多大学Temerty医学院实验室医学和病理生物学教授Karim Mekhail教授说。“它还使许多先前发表的其他生物体的发现适用于人类DNA修复，这应该有助于科学更快地发展。”当细胞暴露于辐射和化学物质以及DNA复制等内部过程时，DNA双链断裂就会
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科学-转化医学：为什么老年人容易患上严重的COVID-19
众所周知，老年人患上严重致命新冠肺炎（COVID-19）的风险会增加，但这种易感性背后的内在机制还不完全清楚。加州大学旧金山分校领导的一项新研究显示，免疫系统的功能失调似乎可以解释为什么老年人往往更容易感染严重的COVID-19。这项研究成果于4月17日发表在《Science Translational Medicine》杂志上。通讯作者、加州大学旧金山分校的Charles Langelier及其同事写道：“我们发现，在因COVID-19住院的患者中，衰老对宿主免疫和病毒动态都有明显的影响。”他们认为，研究结果将有助于制定这一高风险人群的治疗策略。在研究中，研究人员采用鼻拭子RNA测序、宏转录
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利用B细胞靶向线粒体代谢来对抗癌症或自身免疫性疾病
一项新的研究表明，被称为调节性B细胞的白细胞可以通过增加或减少其功能来对抗癌症和治疗自身免疫性疾病。在《Nature Immunology》上发表的一项新研究中，伦敦大学学院的研究人员与伯明翰大学和萨里大学的研究人员合作发现，对调节人体免疫系统至关重要的调节性B细胞依赖于一种名为硫氧还蛋白(Trx)的蛋白质来发挥正常功能。通过对健康供体和自身免疫性疾病狼疮(SLE)患者的B细胞样本的研究，研究小组能够确定调节性B细胞的免疫抑制功能是如何需要Trx的，并且代表了自身免疫性疾病的潜在治疗靶点。此外，同样的调节Trx来控制B细胞功能的过程可以通过抑制调节性B细胞功能来帮助治疗癌症。该研究的负责人、伦
来源：Nature Immunology
时间：2024-04-19
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一种强大的新技术：追踪蛋白质稍纵即逝的形状变化
威尔康奈尔医学院的研究人员已经开发出一种强大的新技术，可以产生蛋白质结构变化的“电影”，速度高达每秒50帧。资深作者、威尔康奈尔医学院麻醉学研究特聘教授西蒙·舒林博士及其同事开发了这种新方法，以更好地了解生物分子如何随着时间的推移而发生结构变化。虽然这一领域的研究人员通常会对静态蛋白质和其他分子进行精细成像，以分辨单个原子的位置，但所得到的结构图像或模型只是快照。记录分子结构的动力学——制作电影——是一项更加艰巨的挑战。该研究的第一作者是威尔康奈尔大学生物医学研究生院的博士生蒋怡宁。在他们4月17日发表在《自然结构与分子生物学》杂志上的研究中，研究人员使用了一种相对较新的测量技术，称为高速原子
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生成式人工智能 开发针对BRCA缺陷癌症的口服Polθ抑制剂
三阴性乳腺癌 (TNBC)中有11-16%、卵巢癌中10-15%存在BRCA缺陷。虽然 PARP 抑制剂治疗大大改善了 BRCA 缺陷肿瘤的生存结果，但治疗效果往往受到 PARP 抑制的固有或获得性耐药性的限制。因此，迫切需要针对 BRCA 缺陷肿瘤的替代治疗策略。DNA 聚合酶 Theta (Pol θ ) 通过 Theta 介导的末端连接 (TMEJ) 修复 DNA 双链断裂 (DSB)，对于维持基因组完整性很重要。 Pol θ介导的 DSB 修复功能丧失在 BRCA 缺陷细胞中具有高度细胞毒性——通过同源重组 (HR) 进行的 DSB 的高保真修复受到损害，导致
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《eLife》以人血为食的“吸血菌”
一些世界上最致命的细菌以人类血液为食，研究人员将这种新发现称为“细菌吸血”。由华盛顿州立大学的研究人员领导的一个研究小组发现，这种细菌会被血液的液体部分或血清所吸引，血清中含有细菌可以作为食物的营养物质。细菌似乎特别喜欢的一种化学物质是丝氨酸，这是一种在人体血液中发现的氨基酸，也是蛋白质饮料的常见成分。这项研究发现发表在《eLife》杂志上，为血液感染的发生和治疗提供了新的见解。华盛顿州立大学兽医学院教授，该研究的通讯作者Arden Baylink说：“细菌感染血液可能是致命的。我们了解到，一些最常见的导致血液感染的细菌实际上能感知人体血液中的一种化学物质，并向它游去。”Baylink和该研究
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父亲的饮食可能导致儿子焦虑/女儿代谢异常
一项对小鼠的研究表明，父亲的饮食可能会影响儿子的焦虑情绪，甚至在他们怀孕之前就影响女儿的代谢健康。发表在《自然通讯》(Nature Communications)杂志上的一项新研究发现，雄性小鼠饮食中的宏量营养素平衡会影响雄性小鼠的焦虑行为水平和雌性小鼠的代谢健康。这项研究为理解饮食的影响如何通过父亲的精子从一代传递到下一代提供了一步。它最终可以为准爸爸们提供膳食指南，目的是降低下一代患代谢疾病和情绪障碍的风险。父母喜欢相信他们可以塑造孩子的兴趣和行为，成败参半。但一个国际研究小组的一项新研究证实，小鼠也是如此，父亲通过自己的饮食影响孩子的健康。科学家们已经发现，小鼠父亲的饮食不仅会影响自己的
来源：Nature Communications
时间：2024-04-19
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Nature子刊：分子密码刺激先锋细胞在体内建立血管
心血管疾病，包括中风和心肌梗死，是世界上主要的死亡原因，每年造成1 800多万人死亡。KIT的一个研究小组现在已经在血管中发现了一种负责血管生长的新细胞类型。这一发现可能为治疗缺血性心血管疾病(即由血流量减少或缺乏引起的疾病)提供新的治疗策略。在我们的身体里，一个巨大的血管网络将血液分配到我们的器官，从而确保活跃的细胞得到足够的氧气和营养来发挥作用，例如维持心脏跳动和大脑活动。血管闭塞和氧气输送受损可能导致神经元或心脏细胞死亡，最终导致中风或心脏病发作。血运重建即恢复血管灌注，促进组织再生，需要有功能的血管，但如何有效地实现器官血运重建仍是临床未解决的问题。由于每个器官都有不同的生理功能，因此
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一种酶让蘑菇变得“神奇”
精神活性物质裸盖菇素是所谓的裸盖菇属“神奇蘑菇”最重要的天然产物，这使得这些蘑菇成为一种流行的药物。然而，近年来，裸盖菇素在医学上对许多精神疾病也越来越感兴趣。它在治疗抑郁、成瘾和焦虑方面显示出令人鼓舞的效果。因此，裸盖菇素作为一种活性药物成分已经处于临床试验的后期阶段。裸盖菇素是由真菌在复杂的生化过程中由氨基酸l -色氨酸形成的。甲基转移酶PsiM在这一过程中起着重要作用。它连续催化两个甲基化反应，这是生产裸盖菇素的最后两个步骤:“自然界中有很多甲基转移反应，” Dirk Hoffmeister说。他是耶拿弗里德里希席勒大学药物微生物学教授，并领导莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研
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