塞莱拉公司鸟枪法测序基因组要价45000美元

　　

生物通编译：今天在塞莱拉公司于爱丁堡召开的一次旨在推销其鸟枪法测序的小鼠基因组和一个配套的软件包的会议上，苏格兰学术界给了塞莱拉公司，这家美国的基因组数据公司一个冷淡的回应。这次在Murrayfield会议中心召开的会议，标榜为一次比较基因组学应用的科学会议，但是立即发展为一次商业性市场活动。对于40家左右应邀的代表而言这一变化太快了。明天在伦敦还计划召开一次类似的会议。

塞莱拉公司强调现在用来获取基因组信息的方法的革新性的努力没能影响Alan Archibald，多利羊的老家——爱丁堡罗斯林研究所基因组学研究负责人。他告诉BioMedNet News说，塞莱拉公司“过高地评价了数据的前基因组表达和后基因组表达之间的差别。”他补充说：“我不提倡在后基因组时代使用手工业者的方法，我们不应该回退到使用箭。”

Archibald还质疑了塞莱拉公司数据的精确性。他补充说：“现在存在着这样一种看法，就是‘计算机告诉我这是对的，那么这就是对的’。但是我们不应该总是相信塞莱拉公司组装的结果告诉我们的答案。”

在这些批评之前，斯坦福大学数学家Samuel Karlin和同事们对塞莱拉公司的果蝇基因组序列进行了分析，结果发表在上个月的Nature上，表明在塞莱拉公司和斯坦福自己的数据之间存在“大量的明显的差异”。

在这次会议上，塞莱拉公司的学术界销售负责人John Lewis指责这些批评就象是“茶杯中的暴风雨”。他说，在任何情况下，该公司都做好准备将来对Nature上发表的这篇文章做出回应。

塞莱拉公司的小鼠基因组序列目前还不能公开获得，但是可以通过购买一个分析软件平台获得序列。一个研究负责人签三年的合同，购买这个软件包——塞莱拉发现系统（CDS）的价格是45000美元。

CDS是目前分析塞莱拉公司小鼠基因组序列的唯一方法。塞莱拉公司宣称已经通过对整个小鼠基因组序列测序超过五遍而得出现在的基因组序列。该软件包中还包括许多公共的和私有的，与基因和蛋白结构信息以及疾病相关的数据库和数据压缩软件的使用。每个使用者多付4000美元，购买者可以获得使用塞莱拉公司350万人类单核苷多态性（SNP）的使用权。

格拉斯哥大学研究基因组数据库的Ela Hunt还表示了对使用者与塞莱拉公司的数据库相联后私人研究信息的安全性的担心。她说：“在任何法律条约中都必须加入塞莱拉公司不能使用这些数据的条款。在一个数据库世界，任何网络管理者都可以公开信息。”

塞莱拉公司的生物信息学负责人Tony Kerlavage努力让Hunt放心。他坚持说：“我们没有这样做的意图，我们不会看任何私人数据，我们的IT部门将对这些数据进行严格的保密，塞莱拉的科学家不会进入使用者的领域。”

塞莱拉公司在爱丁堡会议上介绍了一名感到满意的客户，Mark Magnusson，田纳西洲Vanderbilt大学的分子生理学和生物物理学教授。自从去年5月以来，他一直在使用CDS软件包来辅助他进行II型糖尿病研究。他说：“尽管in silico（硅片上的）生物学存在着危险，但是塞莱拉公司的信息让我做了这么多我在实验室不可能做的事。”（版权所有 转载请注明）

——摘译自6月8日（heartlake）