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众多动物排队进行基因组测序
【字体: 大 中 小 】 时间:2001年07月23日 来源:
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| 灵长类动物研究领域正在争论先测序短尾猴(左)还是黑猩猩(右)的基因组序列。 | |
生物通编译:马里兰州Chevy Chase消息 - 小鼠基因组测序正在进行当中,其它那些生物可以更好地帮助解释人类基因组呢?大鼠是一种无可争议的重要实验动物,而斑马鱼带来了对发育过程的清晰了解。但是随着人类基因组工作到2003年的结束,其它三个物种的解码工作也只能让全世界现有的每秒2000碱基的测序水平维持运转到那会儿。因此现在很有必要在测序流水线上增加其它物种,然而选择接下来进行测序的物种并非易事,因为有如此众多的专家正在游说将他们认为重要的物种列为接下来的测序对象。
竞争的奖金将是丰厚的,研究人员在上周于此召开的一次工作会议上达成一致,计划建立选择进行测序的物种的标准。如果一种生物被选定,那么研究这一物种的团体将来将肯定得到雄厚基金的支持,而且将得到发展。就象国家癌症研究所的哺乳动物遗传学家Steven O'Brien所说:“被选中的物种将获得巨大成功。”
在这次由国家人类基因组研究所(NHGRI)发起的工作会议上,四十多名研究者极力强调猪,猫以及海胆等等各种物种基因序列的研究价值。微生物研究者通过图表向大家证明微生物并不是现有生物中的一小部分。灵长类动物明显占据了讨论的最主要地位,至少在候选名单中,虽然没有黑猩猩研究专家在场,短尾猴仍然占据有利地位。
同时会议组织者要求大家暂且将工作分配的争论放置一边,而先确定决定接下来进行何种生物基因组测序的标准。在会议的副主席David Botstein和Robert Horvitz的催促下,与会专家们一致建立了两套标准。一套是他们称为总体考虑的标准,比如获得序列的容易程度,和那些将使序列有用的因素。这些包括基因组大小,现有技术知识,试验适宜性,以及活跃的,热切的研究团体。
另一套标准是科学意义性标准,用这套标准可以对一个特定生物能否保证研究者进行研究进行评定。这套标准更难把握,因为了解人类疾病或探求进化关系的工作需要研究许多不同的生物。比如为了研究物种特性的进化,科学家们需要对生命的每个分支上的物种群——如软体动物,蚯蚓,海星进行采样。但是要开发新的人类神经生物学模型系统,一个与人类有密切关系的物种将更为有用。其它生物也同样有助于帮助研究人员理解人类和模型生物的序列数据。尽管与会科学家们列出了大约10个问题,但是他们很明智地没有试图将这些问题进行排序。
NHGRI所长Francis Collins说,竞争的下一步将是将他们的初步想法转变成正式的建议。会议的副主席希望在接下来的几个月内签署一份报告。Collins建议在接下来的数年内,NHGRI要召开更多的会议,支持那些选择后面存在的探索科学和政治问题的领先项目。(版权所有 转载请注明)
——摘译自Science Volume 293, Number 5529, Issue of 20 Jul 2001, pp. 409-410(heartlake)