流感病毒变异分析图

【字体: 时间:2004年06月30日 来源:

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生物通快讯:像流行时尚一样,流感病毒每年都在变幻它们的外形。病毒外表的突变有助于病毒逃避人类免疫系统的攻击,从而导致每年流感的发生。现在,研究人员开发了一种数字化的工具,有助于分析并将这种“抗原漂流”形象化。这项研究也适用于其它种病毒,可能有助于每年筛选最适合流感疫苗变得容易些。

研究集中在H3N2上,这个感染人类的流感病毒首次出现于1968年。为了跟踪它的进化轨迹,世界各地的研究人员通常用新发现的H3N2病毒感染动物、收集抗血清并测定血清中和其它H3N2变株的效果。当由一株病毒引发的抗血清能中和另一株病毒时,人们就推测这两个病毒株很近似。而且接触过一种病毒的人可能也对另一个产生免疫;如果它们不能相互中和,那么它们之间的亲缘关系就较远。“但是,由于缺乏一种形象的表示方法,只是广泛收集表格和数字是很难处理的,”St. Jude Children’s Research Hospital的流感研究人员Richard Webby说。

Erasmus University的计算机专家Derek Smith说,一张流感关系图是必须的。就像根据地图中的距离表能够大体描绘出一个国家地图,从血清化验中得到的病毒之间的距离可以用来在图上定位病毒株。发表在本周的Science网络版上的一项研究中,Smith和同事们(包括EUR的病毒学家Ron Fouchier和Los Alamos国家实验室的物理学家Alan Lapedes)提供了一张从目前追溯到1968年的流感的变异关系图,11组近缘流感病毒显示出流感病毒在变异逃避人类免疫系统攻击的过程。

为了验证这张地图的可靠性,研究组根据图上的距离预测了此前未经配对的抗血清和病毒将会匹配,然后在实验室验证,结果发现这种预测非常可靠。

“令人欣慰的是他们的工作真实可靠,”Webby说。能将抗原漂移形象化,以及预测一种抗血清对另一株病毒的作用进也将有助于每年的筛选流感疫苗过程。

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