第一个水蜜桃基因组芯片用Oligo Set

生物通快讯：炎炎夏日，正值美味可口的桃子上市季节，德国QIAGEN公司宣布第一个桃（水果）基因组的芯片专用的即用型寡核苷酸试剂盒（Array-Ready Oligo Set）的面世。这个新的oligo set含有4806个与桃发育相关的基因的70mer探针，为芯片分析水蜜桃基因表达提供一个有用的工具。

桃子基因组Oligo Set成为新近的不断扩展中的植物基因组Array-Ready Oligo Stes家族的新成员。目前已经有葡萄藤基因组的Oligo Set，而今年下半年，番茄基因组Oligo Set和马铃薯基因组Oligo Set将会面世。

桃子基因组Oligo Set是利用世界多个桃子基因组研究项目所公开的序列来构建的，部分序列来源于ESTree协会的研究成果，包括在意大利几个致力于研究桃子基因组和功能基因组研究的研究中心。

ESTree协会最根本的目标是建立全面的桃EST数据库（ www.itb.cnr.it/ESTree），并在来自EST数据库的基础上通过芯片（微矩阵）分析其生化途径；在现有分子连锁图谱上对EST进行SNP分析。QIAGEN的Array-Ready Oligo Set将为我们达到这些目标提供了一个无价的工具，”Carlo Pozzi博士说。

ESTree目前的成员很多，其中FPTP（Fondazione Parco Tecnologico Padano）和Padua、Udine大学进行EST测序、绘图和维矩阵设计，而ISF和CNR则参与数量性状研究、生理学研究和数据库设计。

QIAGEN使用精妙的方法和独家的软件进行探针设计。每个探针有均一化的解链温度并且含有一个5’端的氨基酸连接臂以方便底物的附着。QIAGEN Oligo Microarray Database (OMAD)将会提供水蜜桃基因组Oligo Set提供更详细的注析。这个Oligo Set以384孔板提供，每孔有600pmol探针，对照有24个探针，其中12个正对照，12个负对照。还有96试用装。