2015 Nature、Science你不容错过的那些论文

　　转眼又到了年中，各位或许都在忙于应付各种考试，准备研讨会，参加会议，撰写论文，完成试验等等各种事务。而遗憾的是，却从未留出足够的时间来享受（或甚至找到）一两篇真正好的研究文章。近日，BioTechnique网站为我们列出了今年值得关注的一些好的文章，来看看其中有没有你错过的吧……

　　

生物通报道  转眼又到了年中，各位或许都在忙于应付各种考试，准备研讨会，参加会议，撰写论文，完成试验等等各种事务。而遗憾的是，却从未留出足够的时间来享受（或甚至找到）一两篇真正好的研究文章。近日，BioTechnique网站为我们列出了今年值得关注的一些好文章，来看看其中有没有你错过的吧……

Cusanovich, D.A. et al., “Multiplex single-cell profiling of chromatin accessibility by combinatorial cellular indexing"
Science. 2015 May 22;348(6237):910-4. doi: 10.1126/science.aab1601.

从表面上看，这篇论文主要是定义了巨大数量单细胞的染色质状态。然而再细细品味一下，你或许就会发现Jay Shendure最新研究方法中一些有趣的东西——它是基于一种组合索引策略，除了染色质状态这种策略还可用于排序很多的事项。事实上，这并非是第一篇采用这种索引方法的“大”文章：Shendure的研究小组过去就曾采用这种方法相序排列了基因组DNA。因此，我们认为这篇论文值得一看，当这种索引策略再次出现时——这次或许就会在你的领域里。

Rovner et al. “Recoded organisms engineered to depend on synthetic amino acids”
Nature. 2015 Feb 5;518(7537):89-93. doi: 10.1038/nature14095.

现在转基因生物(GMOs)出现越来越频繁。采用诸如CRISPR/Cas9一类的方法很容易就可以实现对生物的基因组改造，在未来有可能我们会看到越来越多的转基因生物。这由此提出了一个问题：如何最好地隔离和管控这些转基因生物？

这篇在2015年初发布的文章报告了首个“基因组重编码生物”（recoded organism），研究人员通过表达一些基因限制了基因组重编码生物的生长，而这些基因的表达则依赖于外源供应的一些非常特异的合成氨基酸（延伸阅读：两篇Nature公布转基因技术里程碑成果 ）。

这项研究工作的影响相当广泛且令人印象深刻，它展示了分子生物学的未来。

Liang et al. “CRISPR/Cas9-mediated gene editing in human tripronuclear zygotes”
Protein Cell. 2015 May;6(5):363-72. doi: 10.1007/s13238-015-0153-5.

我确信你肯定听说了这篇首次在人类细胞中测试CRISPR/Cas9基因组编辑的文章。这篇论文的发表引发了在推动基因组编辑技术进步之时怎样做才最好的相关激烈讨论，因此对于所有对未来数年里科学界将如何适应新技术感兴趣的人来说这篇文章值得一读。

此外，研究结果还表明了CRISPR-editing还未达完美，我们还需要退回去更多地了解这一技术，或是在未来的实验中改进方法，尤其小心使用它。而无论从哪方面来讲，这篇论文所具有的独特意义都值得你在今夏读一读它（延伸阅读: Nature：中国科学家用CRISPR/Cas9改造人类胚胎 ）。

Chen et al. “Expansion Microscopy”
Science. 2015 Jan 30;347(6221):543-8. doi: 10.1126/science.1260088.

来自麻省理工学院的研究人员Ed Boyden和同事们在这篇文章中，采用了一种非常简单成本也很低的方法，他们没有从显微镜上下功夫，而是从组织样本下手，利用一种吸水膨胀的聚合物将组织样本整体放大，使得采用普通共聚焦显微镜也能达到超越200nm的分辨率。

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该研究团队采用这种膨胀显微技术（Expansion Microscopy）在常规共聚焦显微镜下成像了500×200×100微米的大脑组织切片。而其他超高分辨率技术难以成像这么大的样本(延伸阅读：Science：低成本的超高分辨率成像 )。

Uhlen et al. “Tissue-based map of the human proteome”
Science. 2015 Jan 23;347(6220):1260419. doi: 10.1126/science.1260419.

由Mathias Uhlen和同事们撰写的这篇论文之所以尤其有趣，是因为研究人员利用了两种强大的方法——基于组织芯片的免疫组化和RNA测序来了解细胞中发生的事件，并第一次检测了人类基因组的业务终端——32个不同人类组织中蛋白质的表达模式。

这项研究为我们打开了开始了解人类细胞和组织中的蛋白质生成模式和过程的大门。

（生物通：何嫱）