中国水产科学院李健课题组：基于iTRAQ技术鉴定梭子蟹中与生长相关的差异表达蛋白

　　目前关于梭子蟹的研究已经很广泛，但关于其遗传背景信息的研究亟待深入。目前为止，关于梭子蟹蛋白质组学的研究比较少。在这项研究中，中国水产科学院李健课题组利用iTRAQ蛋白质组定量分析技术对梭子蟹中与生长相关的蛋白质组进行了分析与鉴定，以了解其分子机制。

　　

梭子蟹广泛分布在韩国，日本，中国和东南亚的沿海水域。这种物种栖息在河口和沿海水域。 在中国，它是一种主要的食用蟹种和重要的渔业资源，也是中国重要的养殖物种。目前关于梭子蟹的研究已经很广泛，但关于其遗传背景信息的研究亟待深入。目前为止，关于梭子蟹蛋白质组学的研究比较少。

在这项研究中，中国水产科学院李健课题组利用iTRAQ蛋白质组定量分析技术对梭子蟹中与生长相关的蛋白质组进行了分析与鉴定，以了解其分子机制。从梭子蟹五种组织：眼眶、鳃、心脏、肝胰腺和肌肉中分离总蛋白，利用iTRAQ技术对每个组织中等量蛋白质进行蛋白质组分析。基于液相色谱与串联质谱法和de novo测序数据，总共鉴定了961个蛋白质。以1.2倍的表达变化作为生理学显着的基准，发现了30个与梭子蟹生长相关的差异表达蛋白（DEP），这些蛋白质大部分是表达上调的，包括参与代谢、免疫反应、DNA重复和蛋白质合成等相关的蛋白质，表明能源守恒是应对生长的重要战略。使用iTRAQ的分析结果与测定的mRNA表达水平之间存在高一致性，突显出了蛋白质组学方法的高重现性，以及其在阐明梭子蟹生长调节分子机制中的巨大价值。

 
图 梭子蟹中八个基因的mRNA和蛋白质水平比较

在本研究中，第一次使用iTRAQ方法来研究梭子蟹中生长相关的分子机制。研究确定的30种新型与生长相关的差异表达蛋白，包括GTP-binding核蛋白和几种细胞内相关蛋白。 此外，本研究还鉴定了多种免疫及脱皮相关蛋白，揭示了该物种的生长机制。研究还发现，近交繁殖抑制许多生理活性并降低了细胞间蛋白质浓度。

本研究中的iTRAQ蛋白质组定量分析由联川生物协助完成。

用户文章
Ren XY,et al.(2016)iTRAQ-based identification of differentially expressedproteins related to growth in the swimming crab,Portunustrituberculatus. Aquaculture Research. doi:10.1111/are.13155

联川生物为研究人员提供iTRAQ蛋白质组定量分析技术

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