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Nature技术人物:为何想象力很重要
【字体: 大 中 小 】 时间:2016年02月26日 来源:生物通
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Jason Chin在其学术生涯中首先接受的是成为一名化学家的教育,之后又是生物学家,但他表示这些都不是他特别感兴趣的。他喜欢各种不同观点结合在一起,“我认为通过与各种新的ideas接触,抛却不同学科的偏见能令我们成为更优秀的科学家,”Chin说。
——如何结合生物学、化学和合成生物学为一蛋白添上合成氨基酸,这考究个人的想象力
生物通报道:Jason Chin在其学术生涯中首先接受的是成为一名化学家的教育,之后又是生物学家,但他表示这些都不是他特别感兴趣的。他喜欢各种不同观点结合在一起,“我认为通过与各种新的ideas接触,抛却不同学科的偏见能令我们成为更优秀的科学家,”Chin说。目前作为剑桥大学MRC分子生物实验室(MRC LMB)项目负责人,Chin成立了LMB的化学与合成生物学中心,同时他也任职于剑桥大学化学系。
“蛋白质是一种迷人的分子,”要想了解这种分子如何在细胞和有机体中行使功能并不容易,尤其是尝试将蛋白分子变化与宏观现象联系起来时。Chin与他的团队近期结合了化学、分子生物学和合成生物学技术,修改小鼠胚胎干细胞中细胞染色体上的一个组成元件,并检测了这一变化带来的影响。
了解特定染色质修饰带来的影响能帮助生物学家和生物工程师,“如果我们能操控可遗传,调控子细胞性状的染色质修饰,那么就能系统调控一个细胞的表观遗传状态,实现合成表观遗传学,”Chin说。
Chin等人将非天然氨基酸有效并保持稳定水平的加入到组蛋白上,并由此构建了稳定的细胞系。他们在组蛋白H3多位点基因编码了一种特殊的乙酰化赖氨酸,用N-ε-乙酰基-赖氨酸(N-ε-acetyl-lysine)替代了赖氨酸,这扰乱了细胞,由此研究人员比较了非天然氨基酸实验组与野生型组之间的差异。
这项工作构建出了一种细胞内部系统的平行世界:pyrrolysyl-tRNA synthetase/tRNACUA(tRNA上附加的一种酶),传递氨基酸到相应mRNA密码子位置的“交通工具”。这种新合成酶与tRNA相互作用,但与细胞内其它合成酶或tRNAs却没有交集,Chin说。合成氨基酸会被加附到正在合成的氨基酸链上(改造了终止密码子),由此形成聚合物。
仅仅通过酶对染色质的修饰会改变染色质中的氨基酸,而且也能改变许多其它蛋白,“这意味着我们无法设计了解染色质特殊位点修饰带来的变化,”Chin说。而通过这种平行且独立的路线,我们能单独改变染色质中靶标氨基酸,从而有助于了解某种修饰的作用。
Chin的同事,剑桥大学的化学家Shankar Balasubramanian认为Chin是“一个想象力丰富,性格温和的人,他能淡定的解决许多复杂而且重要的挑战”,Chin在耶鲁大学获得了他的化学生物学博士学位,之后进入Scirpps研究院从事博士后研究。
原文检索:
Elsässer, S.J., Ernst, R.J., Walker, O.S. & Chin, J.W. Genetic code expansion in stable cell lines enables encoded chromatin modification. Nat. Methods 13, 158–164 (2016).