CRISPR先驱发表研究新成果

【字体: 时间:2016年05月24日 来源:生物通

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  加州大学伯克利分校的研究团队前不久在Molecular Cell杂志上发表文章,揭示了CRISPR介导免疫记忆的一个重要机制。这篇文章的通讯作者是著名CRISPR先驱Jennifer A. Doudna。Doudna教授是CRISPR技术的共同开发者,曾因这一技术获得了“生命科学突破奖”(Breakthrough Prize),是CRISPR专利的有力竞争者。

  

生物通报道:细菌和古生菌一直在与入侵者做斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。Cas1-Cas2蛋白复合体会捕获30–40bp的外源DNA,将它们整合到CRISPR的间隔区,形成自己的免疫记忆。如果这种外源DNA再次入侵,细菌就能够及时将其剪切,从而保护自身安全。

加州大学伯克利分校的研究团队前不久在Molecular Cell杂志上发表文章,揭示了CRISPR介导免疫记忆的一个重要机制。这篇文章的通讯作者是著名CRISPR先驱Jennifer A. Doudna。Doudna教授是CRISPR技术的共同开发者,曾因这一技术获得了“生命科学突破奖”(Breakthrough Prize),是CRISPR专利的有力竞争者。

规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强,很快便成为了生物学领域的香饽饽。

已知CRISPR-Cas的外源序列插入受到严格调控,整合在CRISPR前导序列(富含AT)的末尾。Doudna及其同事发现,大肠杆菌E. coli获取外源序列需要蛋白IHF(integration host factor)。IHF结合前导序列并且诱导DNA弯曲,允许Cas1-Cas2整合酶催化外源序列插入。这项研究表明,CRISPR前导序列在外源序列捕获中起到了重要的作用。

加州大学伯克利分校以Jennifer A Doudna为首的研究团队取得了诸多令人侧目的CRISPR研究成果。去年十月,Doudna及其同事在Nature杂志上发表文章指出,Cas9 的HNH核酸酶结构域构象状态直接控制了DNA切割活性。他们通过分子内荧光共振能量转移(FRET)实验,鉴定了HNH核酸酶结构域的一种激活构象。研究还证实,一个α-螺旋将HNH的构象改变传达给RuvC结构域,激活它实现DNA切割。(更多详细信息请参见:Nature:揭示CRISPR/Cas9的DNA靶向切割机制

今年年初,Doudna团队揭示了CRISPR-Cas9准备剪切DNA时的关键分子结构。在CRISPR-Cas系统中,Cas蛋白与小CRISPR RNA(crRNA)形成复合体,切割与RNA互补的外源DNA。R-loop是I型和 II型CRISPR-Cas的一个典型特征,基因组编辑常用的sgRNA就会和Cas9形成R-loop。为了阐明R-loop的作用,研究人员通过冷冻电镜获得了酿脓链球菌Cas9 R-loop的高分辨率结构。(更多详细信息请参见:CRISPR先驱Science再发重量级成果

四月份,Doudna团队在细菌中发现了一种CRISPR相关的非经典Argonaute。Argonaute蛋白是真核生物RNAi的关键效应子,它也参与了原核生物的基因组防御。Doudna及其同事证实,CRISPR相关Argonaute具有与众不同的特异性。(更多详细信息请参见:CRISPR先驱发表最新研究成果

生物通编辑:叶予

生物通推荐原文:CRISPR Immunological Memory Requires a Host Factor for Specificity

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