纳米孔测序仪这次真的上天啦

【字体: 时间:2016年07月15日 来源:生物通

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  7月18日,美国国家航空航天局(NASA)会将下一批载荷运往国际空间站,其中就包括Oxford Nanopore的MinION测序仪。宇航员将在太空中测试此仪器的功能。他们将对细菌、病毒和小鼠DNA进行测序,并将数据发回地球,以便与地面上的测序结果进行比较。

  

生物通报道 你知不知道,有一种纳米孔测序仪只有U盘那么小,价格低至1000美元,每次运行可产生1 Gb。这么牛,它咋不上天呢?这次,它真的上天啦。

7月18日,美国国家航空航天局(NASA)会将下一批载荷运往国际空间站,其中就包括Oxford Nanopore的MinION测序仪。宇航员将在太空中测试此仪器的功能。他们将对细菌、病毒和小鼠DNA进行测序,并将数据发回地球,以便与地面上的测序结果进行比较。

据约翰逊航天中心的微生物学家Sarah Wallace介绍,MinION是迄今为止唯一一台预计可在太空中使用的测序仪。这台仪器只有U盘大小,这个尺寸使其成为一个理想的选择。与Illumina和Sanger测序仪不同,MinION对震动不太敏感,在运行时也不需要大量的电力。

这就是说,尽管NASA急于测序更多的微生物,包括在国际空间站环境中和宇航员身上发现的那些,但MinION在微重力环境下的可靠性还是得到了确认。目前还有一个问题,那就是样品上样时会形成气泡,因此第一步是了解MinION在太空中的流体动力学。

Wallace表示,他们希望开发一个与太空飞行兼容的过程,将样品上样到测序仪中。NASA也希望开发出一个系统,在国际空间站直接分析序列数据。最终,NASA希望将太空的MinION开放给地球上的科研人员使用。“如果我们证明它确实可以工作,那么我们希望学术界和科学界了解这一点,在下一步工作中考虑使用,”她指出。

Wallace表示,这项技术有望应用在其他星球上。她的同事Aaron Burton正在改造MinION,希望将其与探测火星及其他星球的着陆器相连接。MinION的工作原理不同于其他的测序仪,可检测DNA、RNA或蛋白质,因此它的纳米孔经过改造可检测不同类型的核苷酸。

“据我所知,这是唯一一种让我们有能力探索未知东西的技术,”她说。“我可以去研究样品中存在的所有细菌,而不是像PCR那样需要特异性引物,需要确切知道你在找什么。我们甚至不知道我们在找什么。这项技术满足了这一要求。”

NASA还计划在7月18日将MinION测序仪运往NASA极端环境任务行动(NEEMO)的海底研究工作站。工作站的研究人员和工程师将在水下环境中开展相同的细菌、病毒和小鼠测序实验。其他研究人员已经在计划更多实验,假设MinION在国际空间站中也能工作。(生物通 余亮)

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