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《Nature Genetics》你的遗传分析结果正确吗?遗传学经典研究方法要变一变了
【字体: 大 中 小 】 时间:2018年04月26日 来源:生物通
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孟德尔随机化(Mendelian randomization)分析在将近50%的显著因果关系中存在基因的水平多效性(horizontal pleiotropy),这一发现对药物开发和疾病管理中的生物标志物检测来说非常重要。文章发表于近期出版的《Nature Genetics》。
西奈山伊坎医学院遗传学和基因组学系、麻省总医院和Broad研究所的科学家们发现一个先前被忽视的现象,这项发现证明通过一个共同方法得出的许多人类遗传学研究结论都被曲解了。他们使用一种独特的方法帮助纠正了这些失真。
孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)是利用遗传变异评估肥胖、疾病和死亡率风险的常见方法。研究人员发现,约48% MR研究的结果都被扭曲了(平均扭曲程度131-201%),这意味着这些研究所分析的特定暴露对疾病的影响可能比实际影响更多或更少。而造成这一问题的原因在于基因的水平多效性(遗传变异通过不同于被测试的风险因素途径影响疾病)。
随着基因组分析技术的迅速发展,过去十年,研究人员开发出了多种MR方法来研究健康和疾病问题。MR方法的有效性和校正水平多效性创新方法研究的迫切需要也直线上升。
“MR对药物发现和验证具有重要作用,”伊坎医学院遗传学和基因组学系助理教授Ron Do博士解释道。“它能确认生物标志物与疾病之间是否存在因果关系,否则人们无法得知哪种药物疗法值得研究,此外,它甚至还能潜在地精确预测药物的有效剂量。”
鉴于这些非凡意义,研究人员开发了一款重新评估出现水平多效性的所有MR研究的开源软件,这款名为MR-PRESSO的软件在开源项目托管平台GitHub(https://github.com/rondolab/MR-PRESSO)可供下载。
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原文检索:Detection of widespread horizontal pleiotropy in causal relationships inferred from Mendelian randomization between complex traits and diseases
(生物通:伍松)
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