Cell Research:CRISPR-Cas9功能基因组学筛查找到癌症靶点

【字体: 时间:2018年07月23日 来源:生物通

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  来自荷兰癌症研究所,上海市肿瘤所的研究人员发表了题为“A CRISPR screen identifies CDK7 as a therapeutic target in hepatocellular carcinoma”的研究发现,通过高通量功能基因组学筛查揭示了CDK7可以作为肝癌的潜在治疗靶点。

  

来自荷兰癌症研究所,上海市肿瘤所的研究人员发表了题为“A CRISPR screen identifies  CDK7 as a therapeutic target in hepatocellular carcinoma”的研究发现,通过高通量功能基因组学筛查揭示了CDK7可以作为肝癌的潜在治疗靶点。

这一研究成果公布在Cell Research杂志上。

肝癌是一种多基因参与、多因素介导、病理机制复杂的恶性肿瘤。根据最新的肝癌统计显示,全球每年新增病例850000例,死亡病例800000例。我国肝癌发病率位居世界首位,全球50%以上的原发性肝癌发生在中国。

在临床,sorafenib是进展期肝癌患者的标准疗法,然而仅能获得较低的治疗反应性,特别是在亚太地区sorafenib的中位生存期获益仅为2.3个月。基于进展期肝癌无明显可靶向突变及有效治疗策略的现状,探索肝癌新的治疗策略,己成为该研究领域亟待解决的问题。

在这篇文章中,研究人员运用基于激酶组学(包括针对约500个不同激酶的约6000个gRNAs)的CRISPR-Cas9功能基因组学筛查发现一类调控基因转录的细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinases,  CDKs)可能是潜在的肝癌治疗靶点。这类CDKs主要包括CDK7、CDK8、CDK9、CDK12和CDK13,对于转录起始和延长具有调节作用。

生物信息学分析显示CDK7在肝癌组织中显著高表达。使用CDK7抑制剂THZ1处理肝癌细胞株后,部分肝癌细胞株对CDK7抑制剂非常敏感,部分细胞株则不敏感。

研究人员深入研究后发现,c-MYC可以作为预测肝癌细胞对CDK7抑制剂敏感与否的标志物。该研究首次将高通量CRISPR-Cas9筛查技术应用于探索肝癌治疗策略的研究中,有一定的转化医学价值,为肝癌防治提供了新思路。

原文标题:

A CRISPR screen identifies  CDK7 as a therapeutic target in hepatocellular carcinoma



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