GenapSys CEO谈首款测序仪及测序的应用前景

　　GenapSys公司于近日推出了首款基因测序仪GenapSys Sequencer。这款基于半导体的测序平台大大降低了测序成本，有望改变DNA测序的前景。

　　

GenapSys公司于近日推出了首款基因测序仪GenapSys Sequencer。这款基于半导体的测序平台大大降低了测序成本，有望改变DNA测序的前景。在ASHG 2019大会上，GenapSys的CEO Hesaam Esfandyarpour和全球销售副总裁Chris Barbazette接受了BioTechniques的采访，讨论了这款新仪器。

它与以往的测序技术有何不同？

Hesaam：GenapSys测序仪与以往的技术有很大不同。它是基于半导体的，而过去的技术利用光学设备或荧光标签、大功率激光器、照相机、扫描仪等等，带来了一台大型、笨重而昂贵的仪器。相比之下，我们的设备只有iPad大小，使用可放置在掌心的半导体芯片。

我们的芯片有三个版本：100万个传感器、1600万个传感器和1.44亿个传感器。根据用户的需求和应用，所有芯片均可提供广泛的通量，而不会迫使用户集齐多个样本，等待很长时间才能获得数据，而这正是当今测序面临的主要问题之一。

目前，测序运行的成本很高。您首先需要一台昂贵的仪器，且每次运行时都需要大量消耗品。由于运行成本高昂，您需要收集多个样本，这可能会花费几周甚至几个月的时间。这种延迟往往会给晚期癌症患者带来许多问题，因为需要数据才能制定潜在的治疗方案。

我们的设备解决了这一问题，意义深远。因为它以低成本提供了一个灵活的解决方案，这意味着大多数人都负担得起。……我们生活在一个生物学的世界，我们周围的一切都是生物学。如果您掌握了阅读信息的方式，那么这将是一个截然不同的世界。这就是GenapSys所开发的，推动基因组学革命的工具。

您预计这项技术将对精准医疗产生哪些影响？

Hesaam：我们相信，它将让每个研究人员接触到高分辨率生物学，从而加速精准医疗的发展。正如Chris所言，全球有40多万个实验室对基因组学感兴趣，但只有几千个实验室有能力购买传统的（测序）技术。这个平台将基因组学的力量带到研究人员的手中。这意味着他们无需寄出样本，也无需等待数月，在需要时就能获得数据。

我们认为，从科研的角度来看，GenapSys这样的平台能够实现并加速基因组学革命。此外还有其他许多领域，如临床、诊断、食品检测、法医、环境等，（GenapSys的）影响将是颠覆性的。

Chris：移动平台就是一个很好的类比。20年前，我们根本无法想象在移动设备上使用各种技术和应用程序。个性化医疗的一个重要方面是，它围绕着患者的护理点而发展。快速治疗患者，确保医生收到相关的生物学信息，这十分重要。利用移动环境在本地采集信息，开启了这台设备的潜能。

未来五年您对GenapSys有何期许？

Hesaam：GenapSys开发的技术非常强大，而这只是中间版本。利用我们拥有的技术，我们有机会超越这一范围。新款芯片上有1.44亿个传感器，让您能够以最高的分辨率读取信息。这有望帮助我们以完全不同的方式理解生物学。

我相信我们对生物学的了解以及我们收集的数据仍然很有限。若有一种工具能够轻松、低成本地读取分子信息，那将彻底改变。我们的技术可以超越DNA，去读取蛋白质或活细胞，因为传感器并不在乎您要检测什么。在我看来，这是一种独特而强大的应用，在以前是无法实现的。

我认为，基因组学和生物学的进化与计算机相似。最初，只有少数大学才拥有计算机，之后是大型机，然后是网吧。现在我们有了个人计算机、笔记本电脑和智能手机。我预计在基因组学领域也能看到类似的发展。从最初一些对凝胶电泳方法感兴趣的遗传学爱好者开始，这一领域增长缓慢，如今已有成千上万台（仪器）。这就像网吧时代，不久我们将看到去中心化进程。

在未来的5到10年，每个人都有机会接触到分子数据，并将其应用在各种场合。我的博士导师曾经说过：“Hesaam，DNA测序的确掌握在每个人的手中。如果你拥有一台测序仪，那么你可以在餐厅中使用它，看看这条鲑鱼是否来自阿拉斯加。”

分子信息无处不在。人体中的细胞、衬衫中的棉花、我正在喝的咖啡，都是由含有DNA的细胞所组成。医疗保健需要它，食品检测需要它，法医学需要它，环境监测也需要它，等等。我们还不清楚所有潜在的应用，但我们知道未来是美好的，我们对此感到非常兴奋。（生物通 薄荷）