HPV RNA-Seq：一种诊断宫颈癌的新技术

　　法国巴斯德研究所领导的研究团队近日开发出一种双管齐下的新策略，能够评估那些感染人乳头瘤病毒（HPV）的妇女患上宫颈癌的风险。

　　

法国巴斯德研究所领导的研究团队近日开发出一种双管齐下的新策略，能够评估那些感染人乳头瘤病毒（HPV）的妇女患上宫颈癌的风险。这项成果于近日发表在《The Journal of Molecular Diagnostics》杂志上。

众所周知，99%的宫颈癌病例是由HPV引起的。目前有200多种HPV毒株，它们的致癌风险不同。高危毒株包括HPV 16型和HPV 18型，这两种毒株导致了大约70%的宫颈癌。在预测癌症发生的可能性时，区分HPV毒株就显得十分重要。

这篇文章的通讯作者、巴斯德研究所的Marc Eloit说：“我们开发出一种新颖的体外分子诊断程序HPV RNA-Seq，可检测高危HPV的感染，并鉴定出患有高度鳞状上皮内病变的患者，这是宫颈癌前病变。HPV RNA-Seq是一种独特的检测，结合了分子检测（HPV分型）和宫颈细胞系（细胞分型）的优势。”

基于病毒DNA或RNA定量的分子诊断检测在鉴定癌症或癌前病变上具有较低的阳性预测值。然而，基于巴氏涂片的分诊缺乏敏感性，即使与高危HPV检测结合使用，也会导致大量不必要的阴道镜检查。

为此，研究人员结合逆转录PCR和新一代测序两种技术，开发出HPV RNA-Seq。这种组合确保了少量RNA的定量，让人们了解HPV基因的表达水平，同时通过新一代测序技术确定了何种毒株存在于患者体内。

研究团队利用HPV RNA-Seq分析了55名宫颈癌前病变患者的样本。这种检测可通过一组16种高危HPV的检测来确定HPV感染的类型。它的敏感性和检测结果与常用的HPV诊断试剂盒相当。此外，HPV RNA-Seq的另一个好处是能够检测多种HPV感染。

数据表明，HPV RNA-Seq的敏感性为97.3%，阴性预测值为93.8%。同时，研究人员还发现，HPV RNA-Seq的阳性预测能力比细胞学检查更高。对于宫颈诊断检测而言，敏感性至关重要，可以确保不开展任何不必要的检查。

“有效的宫颈癌筛查要求在检测高危HPV感染时具有高的敏感性和阴性预测值，因为HPV检测呈阴性的女性通常在数年后才会再次进行检测，”Eloit解释说。

HPV RNA-Seq技术有望减少侵入性活检的需求。研究人员预计，随着技术的不断进步，他们可以同时运行样本，从而使每次检测的成本降低至10-20美元。他们认为，这项技术还有望用于与HPV相关的肛门癌和头颈癌。（生物通 薄荷）

原文检索

Broad-Range Papillomavirus Transcriptome as a Biomarker of Papillomavirus-Associated Cervical High-Grade Cytology

DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2019.04.010