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OMG!所有的朋友,你们的全新单细胞转录组分析试剂盒来咯!
【字体: 大 中 小 】 时间:2019年12月06日 来源:Takara
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Takara Bio新推出的一款高灵敏度的单细胞全长mRNA分析试剂盒- SMART-Seq Single Cell Kit来咯!该试剂盒基于SMART-Seq技术进行优化改良,具有更高的灵敏度和再现性,适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析。
Takara Bio新推出的一款高灵敏度的单细胞全长mRNA分析试剂盒- SMART-Seq Single Cell Kit来咯!该试剂盒基于SMART-Seq技术进行优化改良,具有更高的灵敏度和再现性,适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析。它可以从已知具有低RNA含量的单个细胞(例如,PBMC)直接生成高质量的全长cDNA,远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2!
图1. SMART-Seq Single Cell Kit 模板转换机制
下面就详细了解一下它的特点吧!
▪ 简便的工作流程-可以FACS或其他方法分选的单细胞起始
▪ 灵敏度高、一致性好-非常适用于单细胞(尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核)RNA-Seq的研究,可检测更多基因
▪ 可靠的全长cDNA制备Kit:优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2
▪ 高度灵活的工作流程-可与自动化设备兼容
图2. 与Smart-seq2法的比较
以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析(所有样本都均一化至1.75M paired-end reads)。
Panel A cDNA的制备方法不同,结果也不同。相比而言,Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高,而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
图3. 与SMART-Seq v4的比较
Panel A 以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc)和SMART-Seq v4(SSv4)合成cDNA(均用19个PCR循环扩增)。所有样本都均一化至1.25M paired-end reads。使用SSsc建库,能获得更高的文库产量。
Panel B 从一位健康供体收集到约50个PMBC单细胞,分别采用SSv4 和 SSsc制备cDNA,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。不论测序深度如何,SMART-Seq Single Cell Kit检测的基因数均是SMART-Seq v4的1.6倍以上。
产品名称 |
包装量 |
Code NO. |
SMART-Seq Single Cell Kit |
12次 |
634470 |
48次 |
634471 | |
96次 |
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