【战疫情】Takara NGS解决方案助力战胜新冠疫情！

　　Takara作为分子生物学试剂行业内的重要一员，愿以高品质、高稳定性、高性价比的产品和高效率的服务，为战胜疫情贡献绵薄之力。

　　

2020年注定是难忘的一年，新年伊始，新型冠状病毒引发的疾病（COVID-19）疫情就一直牵动着千千万万人的心。

Takara作为分子生物学试剂行业内的重要一员，愿以高品质、高稳定性、高性价比的产品和高效率的服务，为战胜疫情贡献绵薄之力。

Takara助力新冠病毒的NGS检测解决方案

相比现阶段应用广泛的RT-PCR检测方法，NGS技术不仅可以有效诊断病毒感染，还可以直接获得病毒的全基因组序列，进而全面分析病毒基因。对病毒的进化来源、致病机理机制进行研究，从而指导临床应用。而且随着时间推移，病毒很有可能发生更多变异，NGS可以动态跟踪病毒变异，不仅可以进行针对性预案，也可以为后期有效的治疗提供基础性研究依据。

Takara提供两种RNA-Seq文库构建解决方案，希望它们快速、简便、高效的特点，助力打赢疫情攻坚战！

方案一：SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian（Code No.634411-634414）

在使用鼻拭子、咽拭子、肺泡灌洗液等临床样本进行病毒NGS分析时，往往会遇到病毒含量少、样本背景复杂、建库过程PCR扩增不均一等问题，给正确分析病毒基因组信息造成困难。

Takara的SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian（Pico v2），可以提供微量病原体样本的宏转录组建库解决方案！

• 250 pg-10 ng 的total RNA起始量，样本稀少也能高效建库！
• 专为低质量样本设计，无需进行rRNA前处理操作！
• 随机引物起始，6小时内即可制备高质量文库！
• 多篇涉及mNGS研究的文章中使用Pico v2进行文库构建，见参考文献1-4

【文献案例】

瑞典乌普萨拉大学的John博士采用宏转录组技术研究中枢神经系统综合征患者脑脊液中的HBV病毒，结合系统发育学发现部分HBV病毒基因组属于Genotype B和C，并与其它一些亚洲病毒基因组类似。其中，SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian用于该宏转录组文库的构建（所用的样本为150 µl脑脊液，total RNA浓度为50-200 pg/µl）。

【参考文献】

1. Pettersson JH, et al. Meta-transcriptomic identification of hepatitis B virus in cerebrospinal fluid in patients with central nervous system disease.[J]. Diagnostic microbiology and infectious disease, 2019,95(4).
2. Boujon CL, et al. Novel encephalomyelitis-associated astrovirus in a muskox (Ovibos moschatus): a surprise from the archives.[J]. Acta veterinaria Scandinavica,2019,61(1).
3. Temmam S, et al. Six Nearly Complete Genome Segments of a Novel Reovirus Identified in Laotian Batflies.[J]. Microbiology resource announcements,2019,8(46).
4. Temmam S, et al. A Novel Polycipiviridae Virus Identified in Pteropus lylei Stools.[J]. Microbiology resource announcements,2019,8(15).

方案二： SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing（Code No. 634888-634894）

疫情爆发以来，科学家们在单细胞研究层面陆续发表了多篇新冠病毒的论文，旨在研究病毒潜在的感染途径，宿主细胞-病毒之间的相互作用关系等。

Takara的SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing由于其卓越的单细胞RNA-Seq分析性能，广泛受到研究者的青睐，可提供单细胞水平的新冠病毒的NGS研究解决方案！

• 1-1000个细胞或10 pg-10 ng total RNA起始，进行快速的全转录组扩增！
• 操作简便，单管完成cDNA制备，避免稀少珍贵的病毒样本损失！
• 基于SMART技术，文库具有出色的转录本覆盖度、基因检出数！
• 建议搭配ThruPLEX DNA-Seq Kit（Code No.R400674- R400677）完成NGS文库构建！

【参考文献】

Justin, T, O'Neal, et al. West Nile Virus-Inclusive Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity in the Type I Interferon Response within Single Cells.[J]. Journal of virology, 2019;93(6):e01778-18.

春天，这个充满希望的季节，序幕已经拉开，武汉的樱花不久后也会满城盛开。
相信“长风破浪会有时，直挂云帆济沧海”！
静待“若待上林花似锦，出门俱是看花人”！

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