SIS-seq:测量细胞的新“时间机器”技术

【字体: 时间:2021年04月19日 来源:Walter and Eliza Hall Institute

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  利用一种新的单细胞技术,研究人员发现了一种理解干细胞如何产生特定细胞类型的方法。这项研究发现了新的基因,这些基因可以编程使干细胞产生树突状细胞,从而启动免疫反应。通过揭示这一过程,研究人员希望能够找到新的癌症免疫治疗方法,并计划将这一技术扩展到其他领域,如发现新的药物靶点。

  

利用一种新的单细胞技术,WEHI研究人员发现了一种理解干细胞如何生成特定细胞类型背后的程序的方法。

研究发现了30种新的基因,这些基因对干细胞进行编程,使树突状细胞启动免疫反应。

通过揭示这个过程,研究人员希望他们能够找到新的癌症免疫治疗方法,并计划将这项技术扩展到其他领域,如发现肿瘤起始的新药物靶点,Sara Tomei女士和Jaring Schreuder先生发表在《免疫》杂志上,这项研究概述了启动由激素Flt3配体驱动的树突状细胞生成的过程,用于免疫治疗。

研究小组开发了一种新技术,将单个细胞的基因表达与其所形成的细胞类型联系起来。

“我们发明了一种称为‘SIS-seq’的技术,以研究从‘母’干细胞平行下降的‘姐妹’细胞,奈克博士说:“由于RNA测序破坏了单个干细胞,你只能测量细胞的基因含量,却失去了知道它会产生什么的机会。因此,没有办法回到过去找出答案。”

“通过让单个干细胞只分裂几次,而不是一路分裂,我们能够分别测试姐妹俩。有些是测试它们的制造物,有些是测试它们的基因含量,我们已经能够将这些基因与所产生的细胞类型联系起来。”

发现了30个新基因

奈克博士说,如果没有技术的进步,使研究小组能够同时回答多个问题,这些发现将不可能实现。

“使用CRISPR屏幕,我们测试了500个预测树突状细胞命运的基因,并发现了30个新的基因,这些基因实际上是用来编程制造树突状细胞的,“他说,

奈克博士说,这一突破可能为抗癌和改善免疫治疗的新药靶点铺平道路。

我们现在有了一份基因清单,可以在免疫治疗的培养皿中尝试生成或促进人类树突状细胞,“他说,

“我们将扩大这项技术的使用范围,以找到控制每种不同人类免疫细胞类型产生的基因。”

通过使用这项技术在单细胞水平上检测细胞,研究人员还打算找到“大爆炸”为了创造新的抗癌药物靶点和改善免疫治疗,我们利用时间机器技术,奈克博士说:“我们希望能够查明组织生成中的哪些正常程序被单个细胞中的致癌基因劫持,然后利用这些信息寻找新的治疗靶点。”

Journal Reference:

  1. Luyi Tian, Sara Tomei, Jaring Schreuder, Tom S. Weber, Daniela Amann-Zalcenstein, Dawn S. Lin, Jessica Tran, Cindy Audiger, Mathew Chu, Andrew Jarratt, Tracy Willson, Adrienne Hilton, Ee Shan Pang, Timothy Patton, Madison Kelly, Shian Su, Quentin Gouil, Peter Diakumis, Melanie Bahlo, Toby Sargeant, Lev M. Kats, Philip D. Hodgkin, Meredith O’Keeffe, Ashley P. Ng, Matthew E. Ritchie, Shalin H. Naik. Clonal multi-omics reveals Bcor as a negative regulator of emergency dendritic cell development. Immunity, 2021; DOI: 10.1016/j.immuni.2021.03.012

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