JP Morgan 2023:10x Genomics公布三大平台新进展

【字体: 时间:2023年01月13日 来源:生物通

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  10x Genomics公司的首席执行官Serge Saxonov在会议上介绍了该公司在Chromium、Visium和Xenium平台上的总体进展。

  

第41届摩根大通医疗保健年会于本周一在美国旧金山拉开帷幕。在经历了两年的在线会议后,此次会议终于能够在线下举行。10x Genomics公司的首席执行官Serge Saxonov在会议上介绍了该公司在Chromium、Visium和Xenium平台上的总体进展。

Saxonov认为,10x公司正处于生物学转折点的前沿。尽管最近的重点是基因组学,但他认为下一阶段的研究范围将扩大,以实现下游的生物学进展、多组学分析以及更先进的细胞、组织和器官研究。

10x Genomics现在有三大支柱平台,它们分别是:Chromium单细胞测序平台、Visium空间基因组学平台,以及Xenium原位分析平台。Saxonov预测,10x的平台将会取代生命科学领域的传统工具箱,包括批量细胞测序、PCR、ELISA、Western Blot等等。

单细胞测序

2016年上市的Chromium单细胞测序平台是10x最早推出的平台。“它帮助你以单细胞分辨率来看看样本中发生了什么,”Saxonov谈道。随着4,000多台仪器的售出,现在围绕着该平台的是一个广泛的生态系统,包括用户、数据集、方案和论文。他表示,公司的投资方向是提高样本数量,降低实验的总成本,以及消除物流方面的障碍。

空间上的升级

Visium空间基因组学平台可帮助研究人员“看到样本中的分子是如何排布的”,Saxonov说。“你能够对整块组织、整个转录组进行无偏倚的分析。因此,它将组织学和分子生物学真正连接在一起。”他报告称,目前有数千个实验室在使用Visium平台,并且有400多篇论文引用。

2022年6月,10x Genomics推出了Visium CytAssist。他说,这台仪器解决了Visium用户的一个主要痛点,能够使用传统的组织学玻片。“它将标准的载玻片与特殊的Visium玻片结合起来,将组织切片上的分子转移到Visium玻片上,”他解释说,“这大大简化了工作流程。”重要的是,这一进展使得那些存档多年的组织样本也能开展空间分析。

“我们的客户对它抱有极大的热情,我们也认为这是运行Visium的最佳方式,”Saxonov强调说。他表示,公司正在加大对Visium平台的投资,重点是扩大组织类型,测定更多分析物,并增加更多的分析流程。不过,他没有提到Visium HD,也就是之前介绍的单细胞分辨率空间转录组学产品。

Xenium原位分析

Xenium原位分析平台于2022年12月正式发售。它能够对数百个RNA靶点进行亚细胞定位分析,以高灵敏度和特异性生成高质量的数据,以获得细胞结构和功能上的新见解。

这个平台可使用定制的基因组合(panel),也与标准的病理学兼容。Saxonov认为,它有着巨大的空间,10x公司已经为Xenium平台的未来功能制定了广泛的路线图,计划提高通量和灵活性,并提供先进的分析和可视化,以及与数字病理学和形态学深度整合。

平衡三条腿的凳子

10x Genomics的这三个平台旨在解决生物学的复杂性。Saxonov表示,他预计公司最初的核心客户群(基因组学研究人员)有可能“倾向于拥有全部平台,因为他们很容易想到使用案例,也会很自然地使用三种平台。”

随着客户群的扩大,Saxonov预计空间客户会出现一些“分裂”,他们可能会热衷于开展组织学分析,但不会走细胞解离路线。“我们确实认为空间有很大的潜力,可以带来新客户。”

不过,据Saxonov介绍,随着Xenium的推出,销售和营销正成为另一个挑战。10x公司在平衡三个平台的销售和营销资源方面非常用心。“这三个平台往往是相辅相成的,围绕一个平台的价值定位去寻找客户,往往有助于将其他平台纳入其中,”他谈道。“我们的目标是适当地平衡这三个平台,并利用销售队伍的规模,促进平台之间的协同效应,以推动所有平台的销售。”

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