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首次报道野生蓝莓端粒-端粒无间隙参考基因组
【字体: 大 中 小 】 时间:2023年11月24日 来源:AAAS
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蓝莓是一种常见的草莓属植物,果实小,以口感鲜美、酸甜平衡、营养丰富而闻名。
蓝莓是一种常见的草莓属植物,果实较小,以口感鲜美、酸甜平衡、营养丰富而闻名。它富含各种维生素和抗氧化剂。然而,栽培蓝莓遗传资源有限,严重阻碍了蓝莓的开发利用。因此,利用野生蓝莓的遗传资源进行育种,对提高栽培品种的抗逆性和品质至关重要。
蓝莓(Vaccinium duclouxii)原产于中国西南地区,是一种具有较高营养、药用和观赏价值的特有野生蓝莓品种。具有较强的抗逆性和环境适应性。然而,缺乏高质量的基因组严重制约了其应用和发展。
2023年10月,《园艺研究》发表了一篇题为“野生蓝莓(Vaccinium duclouxii)的端粒到端粒无间隙参考基因组提供了高可溶性糖和花青素积累”的观点。
本研究采用PacBio HiFi、ONT超长和Hi-C测序数据对duclouxii弧菌基因组进行端粒到端粒(T2T)从头组装。组装的基因组大小为573.67 Mb,成功捕获了全部12条无间隙染色体,共注释了41953个基因。重复序列占54.84%,获得了最完整和高质量的Vaccinium属基因组。通过转录组学和代谢组学的综合分析,揭示了杜氏葡萄成熟过程中糖、酸积累和花青素生物合成的分子机制。该研究为了解蓝莓属植物的进化奠定了基础,并为蓝莓的遗传改良和育种工作提供了有价值的见解。