Nature Medicine：发现以前未知的三种罕见疾病的遗传原因

　　西奈山伊坎医学院的研究人员及其同事利用他们开发的一种新的计算方法来分析来自罕见疾病队列的大型遗传数据集，发现了以前未知的三种罕见疾病的遗传原因:原发性淋巴水肿(以组织肿胀为特征)，胸主动脉瘤疾病和先天性耳聋。

　　

   

   

图片:Daniel Greene博士及其同事使用计算方法确定了三种罕见疾病的未知遗传原因:原发性淋巴水肿、胸主动脉瘤疾病和先天性耳聋。在这张细胞显微镜图像中，一种名为ERG的蛋白质的突变形式，出现在一些淋巴水肿患者中，绿色显示，而细胞核则显示为蓝色。正常情况下，ERG蛋白只存在于细胞核内。然而，在患者中观察到的突变体分布在细胞核外，在细胞的细胞质中。

资料来源:伦敦帝国理工学院国家心肺研究所的Daniela Pirri博士和Graeme Birdsey博士，他们都是《自然医学》论文的合著者。

西奈山伊坎医学院的研究人员及其同事利用他们开发的一种新的计算方法来分析来自罕见疾病队列的大型遗传数据集，发现了三种罕见疾病之前未知的遗传原因:原发性淋巴水肿(以组织肿胀为特征)、胸主动脉瘤疾病和先天性耳聋。

加强对这些疾病和其他疾病相关基因功能的理解，可以为治疗方法的发展铺平道路。研究结果发表在3月16日的《自然医学》在线版。

罕见病影响大约1 / 20的人，但只有少数患者得到基因诊断。在记录的1万种罕见疾病中，只有不到一半的疾病是由已知的遗传原因引起的。对大量罕见疾病患者的基因组测序为发现未知的遗传原因提供了一条途径。然而，研究人员说，大型基因数据集很难处理，显著减缓了研究速度。

“虽然罕见病单独来说很罕见，但总的来说却很常见。这对于我们理解人类生物学以及诊断和治疗的发展非常重要，”该研究的高级作者、伊坎西奈山遗传学和基因组学副教授Ernest Turro博士说。“许多患有罕见疾病的人要奋斗多年才能得到基因诊断。通过开发和应用统计方法和计算方法来寻找罕见疾病的新原因，我们希望扩大对这些疾病潜在原因的认识，加快对患者的诊断时间，并为治疗方法的发展铺平道路。”

研究人员研究了269种罕见疾病类别，使用了10万基因组计划(100000 Genomes Project)中77539名参与者的数据，这是最大的表型和全基因组测序罕见疾病患者数据集之一。研究人员确定了基因和罕见疾病类别之间的260种关联，其中包括以前文献中没有的19种关联。通过国际学术合作，作者通过识别其他国家的其他病例，并通过实验和生物信息学方法，验证了三个最合理的新关联。

“我们希望我们的计算框架将有助于加速全面发现罕见疾病的剩余未知病因。就目前而言，我们希望对某些先前无法解释的原发性淋巴水肿、胸主动脉瘤疾病和耳聋的家庭进行基因诊断，我们还计划以新的方式和其他数据集应用我们的方法，目的是继续揭示罕见疾病的遗传原因。”

文章标题

Genetic association analysis of 77,539 genomes reveals rare disease etiologies