获取基因组的3D视图

　　由Sanford Burnham preby助理教授Lukas Chavez博士领导的研究人员正在利用最新技术对室管膜瘤进行前所未有的研究，室管膜瘤是最致命的儿科脑肿瘤之一。通过可视化基因组如何在肿瘤细胞内组织和排列，他们能够揭示肿瘤中的基因，这些基因可能是未来治疗的目标。研究结果发表在《Nature Communications》杂志上。

　　

   

   

脑和脊髓肿瘤，包括室管膜瘤，是14岁以下儿童中最常见的恶性癌症，也是美国儿童时期疾病死亡的主要原因。由Sanford Burnham preby助理教授Lukas Chavez博士领导的研究人员正在利用最新技术对室管膜瘤进行前所未有的研究，室管膜瘤是最致命的儿科脑肿瘤之一。通过可视化基因组如何在肿瘤细胞内组织和排列，他们能够揭示肿瘤中的基因，这些基因可能是未来治疗的目标。研究结果发表在《Nature Communications》杂志上。

研究人员将重点放在最常见和最具侵袭性的疾病上，这些疾病主要发生在幼儿身上。他们使用了一种名为3D基因组图谱的新兴技术，该技术可以可视化基因在细胞核内的组织方式。研究人员研究了室管膜瘤肿瘤基因组中以前未发现的环。这些环改变了基因的表达方式，从而产生帮助肿瘤生长的信号。研究人员认为，他们的研究结果将为进一步的研究奠定基础，从而导致未来的治疗方法。研究人员还计划研究其他儿科癌症，因为其中许多疾病几乎没有治疗选择。

Chavez说:“人类基因组是由许多蛋白质编码基因和更多的非编码部分组成的，它们都被紧密地包裹起来，盘绕起来，以适应微小的细胞核。我们正在使用尖端技术来研究基因组的包装和缠绕方式，这让我们对基因调控机制有了独特的看法。这种方法有助于我们了解基因组形状和癌症之间的联系。室管膜瘤有许多不同的遗传和分子亚型，可以影响患者对治疗的反应，目前的标准治疗包括手术后放疗，这有长期的风险，治疗引起的神经系统副作用以及继发性癌症。迫切需要新的、有针对性的室管膜瘤治疗方案。如果成功，我们的研究将会带来新的、有效的药物来治疗这些危险的癌症。历史上，科学从两个维度研究基因组，关注基因是如何排列成长而线性的序列的。但基因组是一个3D物体，就像其他任何东西一样，基因在空间中的排列方式会影响这些基因在体内的表达方式。我们已经证实，这些环中的基因结构对室管膜瘤肿瘤至关重要。这意味着我们现在有了许多新的候选治疗靶点，如果没有这项技术，我们将永远无法识别这些靶点。我们努力治疗的肿瘤数量惊人，因为我们根本不知道它们是如何从生物学的角度起作用的。这项工作表明，我们对肿瘤基因组学还有很多不了解的地方，解开这些谜团可能是最终克服这些侵袭性癌症的关键。”