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首次全基因组搜寻:长COVID也有易感基因
【字体: 大 中 小 】 时间:2023年07月13日 来源:nature
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首次全基因组搜索长COVID风险因素可能为更大规模的研究铺平道路。
该研究于7月1日作为预印本发布,使用了从16个国家的6450名长COVID患者收集的数据。研究人员希望这项分析只是一个开始:要解开像COVID这样复杂的疾病,需要大量的数据,这种疾病与200多种症状有关,包括严重疲劳、神经疼痛、注意力不集中和记忆力差。
在英国爱丁堡大学研究医学生物信息学的Chris Ponting说:“这类研究正在进行,这是非常重要的。随着病例数量的增加,它将获得更大的动力和力量。”
免疫学家Stéphanie Longet说,这些研究是了解更多关于长COVID原因的早期步骤,他患有长COVID。她说:“有几个关键问题对患者至关重要,包括治疗和预防。当病因(可能是多因素的)被清楚地了解时,它将有助于治疗那些更容易患上长COVID的患者,并有可能预防长COVID。”
三年多来,全球COVID-19宿主遗传学倡议一直在寻找与发生严重COVID-19风险相关的DNA序列。目前正在进行的搜寻工作已经涉及到参与免疫系统和允许SARS-CoV-2病毒进入细胞的基因。
斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所(Karolinska Institute)的遗传学家、预印本的主要作者Hugo Zeberg说,这项长COVID研究是这一努力的副产品。为了研究这种情况,研究小组收集了24项研究的数据,这些研究共涉及近6500名被诊断为长COVID的人,以及100多万名作为对照的其他参与者。
在一项综合了其中11项研究数据的分析中,研究人员发现,基因组的一个特定区域与发生长COVID的几率高出约1.6倍有关。这段DNA靠近一个叫做FOXP4的基因,FOXP4在肺部和其他器官中很活跃。与长COVID相关的变异也与肺细胞中FOXP4的高表达有关。
之前的研究已经将同一基因与严重COVID-19的风险增加联系起来,Zeberg和他的同事发现它也与肺癌有关。尽管患有严重的COVID-19会增加患长COVID的风险,但研究小组发现,DNA变异对长COVID风险的贡献太大,无法仅用它与严重COVID-19的联系来解释。Zeberg说:“这种变异对长COVID的影响要比对严重程度的影响大得多。”
田纳西州孟菲斯市圣犹达儿童研究医院的生物信息学家中山Cheng说,在其他数据集中复制这一发现将有助于加强该研究的结论。他指出,长COVID分析中使用的许多数据也用于发现FOX4P与严重COVID-19之间联系的分析。新的数据将有助于排除其他因素,如肺癌,可能影响与FOX4P的明显联系的可能性。
Cheng说,即便如此,这项研究仍然是一个突破,未来的研究可能会增加长COVID的遗传风险因素。
Ponting说:“这不仅仅是一个单一的答案,人们的各种弱点都会导致他们无法从COVID中恢复过来。”他和他的同事们提出了一项研究,该研究将包括1.5万名长COVID感染者的DNA。但他说,拨款审稿人拒绝了这个提议,因为他们认为这种情况太复杂,无法用Ponting团队建议的方式进行剖析。
“我不同意,”他说。“这非常复杂,但也非常重要。长COVID的健康和社会经济成本是巨大的。”