《美国人类遗传学杂志》1.3万俄勒冈人基因筛查的研究结果

　　早期基因检测可以改善癌症的预后，但如果没有家族史或负担不起检测费用，人们通常不会进行这种筛查。俄勒冈健康与科学大学的一个临床实验室团队希望通过为俄勒冈州的所有成年人提供免费的遗传性癌症和家族性高胆固醇血症基因筛查，来改变该州居民的这种状况。自2018年以来，该团队对1.3万多名俄勒冈人进行了筛查，并于7月27日在《美国人类遗传学杂志》上发表了他们的方法、发现和经验教训。

　　

早期基因检测可以改善癌症的预后，但如果没有家族史或负担不起检测费用，人们通常不会进行这种筛查。俄勒冈健康与科学大学的一个临床实验室团队希望通过为俄勒冈州的所有成年人提供免费的遗传性癌症和家族性高胆固醇血症基因筛查，来改变该州居民的这种状况。自2018年以来，该团队对1.3万多名俄勒冈人进行了筛查，并于7月27日在《美国人类遗传学杂志》上发表了他们的方法、发现和经验教训。

奈特诊断实验室(Knight Diagnostic Laboratories)的科学家、第一作者蒂莫西·奥布莱恩(Timothy O 'Brien)说:“我们希望这真的可以作为其他想要进行低成本人口筛查的州的榜样。”“我们提供了一种路线图，让未来的筛查项目可以看看我们，看看哪些是有效的，哪些是可以改进的。”

该团队通过社交媒体广告和农贸市场等活动招募参与者。他们甚至设置了自动售货机，个人可以在那里取回和归还收集漱口水唾液样本的测试包。在COVID-19大流行爆发后，个人可以通过邮件申请检测试剂盒。一旦参与者通过符合hipaa的应用程序表示同意，样本就会在临床实验室进行处理，以筛选与遗传性癌症相关的31个基因和与家族性高胆固醇血症相关的1个基因的致病变异。

资深作者、俄勒冈健康与科学大学分子与医学遗传学荣誉教授苏·理查兹说:“我们想报告任何被认为是可操作的致病变异，这意味着你可以对此做些什么。”“可能是改变你的筛查习惯，进行预防性手术或药物治疗，或者咨询你的临床医生。”

在13000多名参与者中，有710人的致病变异筛查呈阳性。所有确认阳性结果的参与者都会接到遗传咨询师的电话，解释他们的结果，结果如何影响他们的疾病风险，以及医疗管理的建议。“遗传咨询对这个项目至关重要，”理查兹说。“公众不容易理解这些基因检测报告，因为它们相当技术性，重要的是要明白，仅仅因为它们携带致病变异可能并不意味着它们会患上那种癌症。”咨询师不仅会告诉他们自己的健康状况和家族史，还会告诉他们如何将这些信息传递给其他家庭成员，因为他们也有感染这种变异的风险。”

当实验室团队第一次开始这个项目时，他们不得不将实验室的基因检测工作流程扩大到原来能力的十倍左右，方法是专注于一组选定的致病变异，并使用机器人的帮助，后者执行更繁琐的任务。这使得该小组每月可以用一名实验室技术人员处理多达1000个样本，估计每位参与者的成本为50美元。为了减少实验室混淆导致假阳性的可能性，所有阳性结果的参与者都被要求使用不同的基因测序方法进行二次筛选。即便如此，研究人员报告说，在他们测序的2万个样本中，没有临床相关的样本混淆。

从他们的测序结果中，研究人员还收集了大量数据，可用于分析俄勒冈州人口的遗传风险因素，并进行额外的研究。大约5%的参与者在一种致病的遗传性癌症变异的筛查中呈阳性，这比之前的几项人群筛查研究报告的结果要高，这可能是因为有个人或家族癌症病史的人更有可能寻求检测。

这种高于预期的患病率也可能是因为先前的研究筛选了一组不同的基因。美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)详细列出了一组与个人状况无关的基因，但建议在进行临床测试的患者中进行分析。然而，如果研究人员只检查这个列表中的基因，他们将错过研究人群中59%的致病变异。此外，研究中发现的最常见的致病变异不在ACMG的清单上。这突出表明，扩大被检测基因的范围可以对在大型筛查研究中获得阳性结果的人数产生重大影响。

该团队计划在未来继续他们的筛查项目，并加大努力，以覆盖更多样化的参与者群体。目前，76%的研究参与者是女性，因此该研究正在研究如何招募更多的男性参与者。此外，通过将他们的同意应用程序翻译成西班牙语，研究人员计划接触更多俄勒冈州讲西班牙语的人口。

奥布莱恩说:“这个项目的总体目标是真正帮助俄勒冈人，让他们掌握这些健康信息。”“我们觉得我们已经能够实现这一目标，并希望它在未来继续成为俄勒冈人健康的有力支持者。”

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这项工作得到了癌症早期检测高级研究中心、奈特癌症研究所和国立卫生研究院的支持。关于利益冲突的信息可以在论文的正文中找到。

《美国人类遗传学杂志》，O 'Brien等人，“人口筛查显示俄勒冈州遗传癌症和家族性高胆固醇血症的风险”https://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(23)00239-2

《美国人类遗传学杂志》(@AJHGNews)由细胞出版社为美国人类遗传学学会出版，是一本月刊，提供了与人类遗传、遗传原理在医学和公共政策中的应用以及分子和细胞生物学相关领域的研究和评论记录。访问:http://www.cell.com/ajhg。要接收Cell Press媒体警报，请联系[e-mail]。

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杂志

美国人类遗传学杂志

研究方法

观察性研究

研究课题

人

文章标题

俄勒冈州人群筛查显示遗传性癌症和家族性高胆固醇血症的风险

文章发表日期

2023年- 7月27日