第一次从灭绝物种中发现RNA

　　一项新的研究显示，从博物馆收藏的室温保存的塔斯马尼亚虎标本中分离出一个多世纪前的RNA分子并进行了测序。这导致了皮肤和骨骼肌转录组的重建首次从一个已灭绝的物种。研究人员指出，他们的发现对复活灭绝物种的国际努力具有相关意义，包括塔斯马尼亚虎和长毛象，以及研究大流行性RNA病毒。

　　

一项新的研究显示，从博物馆收藏的室温保存的塔斯马尼亚虎标本中分离出一个多世纪前的RNA分子并进行了测序。这导致了皮肤和骨骼肌转录组的重建首次从一个已灭绝的物种。研究人员指出，他们的发现对复活灭绝物种的国际努力具有相关意义，包括塔斯马尼亚虎和长毛象，以及研究大流行性RNA病毒。

塔斯马尼亚虎，也被称为袋狼，是一种非凡的顶级肉食性有袋类动物，曾经遍布澳大利亚大陆和塔斯马尼亚岛。这个非凡的物种在欧洲殖民统治后最终灭亡，当时它被宣布为农业害虫，1888年设定了每杀死一只成年动物1英镑的赏金。最后一只已知的塔斯马尼亚虎于1936年死于塔斯马尼亚霍巴特的博马里斯动物园。

最近的反灭绝努力集中在塔斯马尼亚虎身上，因为它在塔斯马尼亚的自然栖息地大部分仍被保存下来，重新引入塔斯马尼亚虎可以帮助恢复它最终消失后失去的生态系统平衡。然而，重建一只功能性活塔斯马尼亚虎不仅需要对其基因组(DNA)有全面的了解，还需要对组织特异性基因表达动力学和基因调控如何工作有全面的了解，而这些只有通过研究其转录组(RNA)才能实现。

“复活塔斯马尼亚虎或长毛象不是一项微不足道的任务，需要对这些著名物种的基因组和转录组调控有深入的了解，这一点直到现在才开始被揭示出来，”Emilio Mármol说，他是最近发表在《基因组研究》杂志上的一项研究的主要作者，该研究由SciLifeLab的研究人员与古遗传学中心*合作进行。是瑞典自然历史博物馆和斯德哥尔摩大学的合资企业。

从塔斯马尼亚虎身上提取的RNA分子

这项研究背后的研究人员首次对一只130岁的干燥的塔斯马尼亚虎标本的皮肤和骨骼肌组织的转录组进行了测序，该标本保存在斯德哥尔摩的瑞典自然历史博物馆的室温下。这导致了组织特异性基因表达特征的识别，这些特征类似于现存的有袋动物和胎盘哺乳动物。

恢复的转录组质量非常好，可以识别肌肉和皮肤特异性的蛋白质编码RNA，并导致缺失的核糖体RNA和microRNA基因的注释，后者遵循MirGeneDB的建议。

斯德哥尔摩大学温纳-格伦研究所分子生物科学系副教授Marc R. Friedlnder说:“这是我们第一次看到袋狼特有的调控基因的存在，比如一个多世纪前灭绝的microrna。”

这项开创性的研究为探索全球各地博物馆储存的大量标本和组织开辟了新的令人兴奋的机会和意义，在那里RNA分子可能等待被发现和测序。

斯德哥尔摩大学和古遗传学中心的进化基因组学教授Love Dalén说:“未来，我们不仅可以从灭绝的动物中恢复RNA，还可以从博物馆收藏的蝙蝠和其他宿主生物的皮肤中恢复RNA病毒基因组，如SARS-CoV2及其进化前体。”

该研究的作者说，他们对未来整合基因组学和转录组学的整体研究发展感到兴奋，从而开创了超越DNA的古遗传学的新时代。