转录组学分析发现与子宫内膜癌和多囊卵巢综合征相关的新型受体

【字体: 时间:2023年09月27日 来源:AAAS

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  2023年9月22日,一篇新的研究论文发表在Oncotarget杂志上,题为“转录组学分析确定了四种可能将子宫内膜癌与多囊卵巢综合征联系起来的新型受体,并生成了转录组图谱。”

  

“这些发现对于提高我们对多囊卵巢综合征中导致EC的机制途径的理解具有重大意义。”

一篇新的研究论文于2023年9月22日发表在Oncotarget的第14卷,题为“转录组学分析鉴定出四种可能与子宫内膜癌和多囊卵巢综合征相关的新型受体,并生成转录组图谱”。

多囊卵巢综合征(PCOS)与子宫内膜癌(EC)风险增加3 - 4倍相关,但分子机制尚不清楚。PCOS子宫内膜IGF1基因的上调可能会增加EC的风险,但这是不确定的。在这项新研究中,来自穆罕默德·本·拉希德医学与健康科学大学和诺丁汉大学的研究人员Fatma Alqutami, Mahmood Hachim, Charlie Hodgman和William Atiomo旨在通过分析公开的转录组数据来调查EC和PCOS之间的联系。

“这项研究的最初目的是通过分析公开的转录组学数据,研究多囊卵巢综合征和多囊卵巢综合征女性子宫内膜中IGF-1和IGFBP基因的表达,并将其与正常子宫内膜进行比较,来研究多囊卵巢综合征和多囊卵巢综合征之间的联系。”

利用NCBI基因表达图谱(Gene Expression Omnibus)对相关研究进行鉴定。差异表达基因(DEGs)的鉴定和分析使用metscape来确定感兴趣的途径。编码分泌到血液中的蛋白质的PCOS DEGs使用Human Protein Atlas血蛋白数据库进行鉴定。

EC deg是细胞受体,使用EcoTyper进行鉴定。这些被交叉以确定哪些EC受体与pcos分泌的蛋白相互作用。在EC中鉴定出7个受体,但上皮细胞上仅表达PTPRF、ITGA2、ITGA3和ITGB4基因。这些基因的通路富集表明,参与的主要和共同的通路是PI3K-AKT信号通路,这与PCOS和EC之间的联系一致。而IGF1在PCOS和EC中下调。

“我们现阶段的结论不支持IGF-1和IGFBP基因在PCOS和EC中存在联系。然而,我们已经确定了四种新的受体,它们可能是多囊卵巢综合征中EC风险的基础,我们相信我们的发现为构建转录组图谱提供了足够的证据,为未来研究多囊卵巢综合征和EC之间的联系以及两种疾病的分子机制提供了基础。”


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