Nature子刊揭示真菌感染的新见解

【字体: 时间:2024年01月15日 来源:Nature Microbiology

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  在最近的选择下鉴定的基因提供了对念珠菌病原体人类相关适应的分子机制的见解。这项研究揭示了已知的和新的与耐药性相关的遗传变异,为改进抗真菌治疗提供了潜在的靶点。这项由巴塞罗那大学生物学研究所比较基因组学实验室进行的研究发表在《Nature Microbiology》杂志上。

  

全球真菌感染每年影响10亿人,造成150万人死亡,由于越来越多的医疗手段加剧了易感性,真菌感染人数正在上升。器官移植后接受化疗或免疫抑制治疗的患者往往出现免疫系统受损。鉴于耐药菌株的出现,目前抗真菌药物的种类有限,以及它们的成本和副作用,这些感染的治疗具有挑战性,迫切需要更有效的治疗方法。

在这种情况下,由ICREA研究员Toni Gabaldón博士领导的来自生物医学研究所(IRB Barcelona)和巴塞罗那超级计算中心-国家中心Supercomputación (BSC-CNS)的研究小组已经确定了六种真菌病原体念珠菌中数百个基因受到近期临床相关选择的影响。

“这项工作强调了这些病原体如何适应人类和抗真菌药物,并提供了有价值的知识,可以更好地治疗念珠菌感染,”巴塞罗那IRB和BSC比较基因组学实验室负责人Gabaldón博士解释说。

来自6个不同物种的2000多个基因组

该研究通过分析来自6种主要念珠菌临床样本的约2000个基因组,深入研究了念珠菌病原体的进化景观。这些基因组存储在公共数据库中。研究人员将这些基因组与参考基因组进行了比较,创建了一个全面的遗传变异目录。

在先前研究耐药菌株工作的基础上,这组科学家进行了一项全基因组关联研究(GWAS),以确定临床分离株中与抗真菌药物耐药性相关的遗传变异。该方法提供了对三种念珠菌对七种抗真菌药物的已知和新的耐药机制的见解。“此外,该研究还发现了一个令人担忧的发现:通过易感菌株和耐药菌株之间的交配,耐药性可能会传播,从而导致耐药念珠菌病原体的流行,”同一实验室的博士后研究员、该研究的第一作者Miquel àngel Schikora-Tamarit博士解释说。

此外,通过关注最近在临床菌株中获得的变异,研究人员发现了最近选择的共享和物种特异性遗传特征,这些特征告知了哪些适应可能需要在与人类相关的环境中茁壮成长和传播。

除了对念珠菌适应性的新见解之外,该研究还提供了一个有价值的资源,即变种、选择特征和耐药性驱动因素的综合目录。这些知识不仅有助于我们对这些感染的理解,而且为未来的实验和开发更有效的治疗念珠菌感染的潜在进展奠定了基础。


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