Science子刊：HIV反弹感染最可能的来源

　　来自德克萨斯生物医学研究所(Texas Biomed)的研究人员利用非人类灵长类动物病毒的基因测序技术，鉴定出……

　　

来自德克萨斯生物医学研究所(Texas Biomed)的研究人员利用非人类灵长类病毒的基因测序技术，在停止抗逆转录病毒治疗的第一周后，腹部淋巴结是反跳感染的主要来源，这一发现对潜在的新HIV疗法具有启示意义。

这项关于猴免疫缺陷病毒(SIV)的研究发表在《Science Translational Medicine》杂志上。SIV与HIV密切相关，通常被用作动物模型中研究HIV的代理。

“淋巴组织是已知的潜伏HIV的大储存库，”德克萨斯生物医学教授Binhua“Julie”Ling说。“然而，目前还没有明确的证据表明它们是最初病毒反弹的来源——这只是一个假设。现在，我们有证据表明SIV，因此潜在的艾滋病毒，隐藏在特定类型的淋巴结和脾脏组织中，并且是一些在治疗停止后首先重新出现在血液中的病毒。”

抗逆转录病毒疗法(ART)在将HIV病毒抑制到血液中检测不到的水平方面表现出色。然而，少量潜伏病毒隐藏在全身，包括大脑、肺、肠道、脾脏、淋巴结和其他器官。一旦停止治疗，就为病毒的反弹打开了大门。

Ling博士说:“如果我们能确定病毒反弹的起点，我们就能致力于开发针对这些组织的治疗方法，从一开始就阻止病毒的传播。”

Ling博士和她的团队使用了几种先进的基因工具和测序技术来追踪这种病毒。他们与弗雷德里克国家实验室艾滋病和癌症病毒项目的Brandon Keele博士合作，后者产生了条形码病毒。库存中有9000多种病毒具有独特的基因条形码，“就像你去沃尔玛，每件商品都有独特的条形码需要扫描，”Ling博士解释说。

这些条形码病毒被注射到7种非人类灵长类动物身上。感染确定后，灵长类动物开始接受抗逆转录病毒治疗。在接受抗逆转录病毒治疗4到6个月后，这些动物的血液中要么有非常少量的病毒，要么没有可检测到的病毒，就像接受抗逆转录病毒治疗的艾滋病毒感染者一样。

当抗逆转录病毒治疗一年多后停止治疗时，研究人员能够评估病毒反弹的最早阶段。

多亏了条形码病毒，他们可以在停止治疗7天后识别出病毒在哪些组织中复制得最快，传播得最远。

他们将血浆中最普遍的条形码与特定组织中检测到的条形码相匹配。值得注意的是，在7天的时间里，标准测试没有在血液中检测到任何病毒——存在的数量太低而无法检测到——但更敏感的深度测序却检测到了。

研究人员发现了三个主要因素:肠系膜淋巴结，它位于连接肠道和腹壁的组织中;脾脏是淋巴系统的一部分，负责过滤血液;腹股沟淋巴结，位于腹股沟。

通过进一步的分析，研究人员发现，肠系膜淋巴结和脾脏中的CD4 T细胞(一种免疫细胞)具有更高数量的完整病毒和复制活性，这与血浆中这些区域的条形码病毒的较高比率相对应。内布拉斯加大学林肯分校的Qingsheng Li博士使用一项新技术进一步证实了这一点。

有趣的是，一些动物没有显示出病毒反弹的迹象，这表明它们在停止治疗后的第一周比其他动物更好地控制了病毒。通过单细胞测序和转录组学分析，研究小组确定了一些引起正常细胞功能失调的基因，这些基因可能在经历非常快速反弹的动物和继续抑制病毒活性的动物之间的差异中发挥作用。

研究人员对更多地了解这些基因以及它们如何影响人类免疫反应感兴趣。

研究人员承认，7只动物的研究规模很小，组织样本量也有限。尽管如此，研究结果指出了探索特异性靶向治疗的关键器官。

Ling博士说:“全身有800多个淋巴结。“了解针对哪种类型的淋巴结可以带来更有针对性的疗法或治疗，并有望防止艾滋病毒传播并延长艾滋病毒缓解期。”