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Nature Methods:ProHap能够生成人类蛋白质组学数据库
【字体: 大 中 小 】 时间:2024年12月11日 来源:AAAS
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由于卑尔根大学开发的一种新方法,研究人员现在可以在考虑种群多样性的情况下改进蛋白质分析。
分析队列研究中的蛋白质序列是通过比较参与者数据与从人类基因组预测的蛋白质序列来完成的。
卑尔根大学临床科学系副教授Marc Vaudel说,“今天,所有参与者都使用相同的参考蛋白质,但我们都是不同的!我们发现,决定我们是谁的微小基因变化产生了一种偏见:对于那些与参考资料不同的人,目前的信息方法对他们的部分蛋白质是盲目的。”
为了解决这个问题,卑尔根的研究人员开发了新的模型,从大型基因面板中构建序列。他们的新方法捕获了最有可能在人群中观察到的蛋白质序列。
设计该方法的博士候选人Jakub Vaíek补充说,考虑到队列参与者之间更大的多样性是将医学研究细化到个人资料的关键。
然而,许多人群在基因面板中没有很好地代表,多样性在当前数据模型中整合是具有挑战性的。
“在公平对待所有患者之前,我们还有很长的路要走,但我们正在取得良好进展,”Vaíek补充道。
新方法刚刚发表在著名杂志《自然方法》:https://www.nature.com/articles/s41592-024-02506-0上