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表观遗传漂移是表观遗传时钟信号的基础
【字体: 大 中 小 】 时间:2024年02月08日 来源:AAAS
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一篇新的研究论文发表在inAging杂志上,题为“表观遗传漂移是表观遗传时钟信号的基础,但对寿命干预、发育和细胞去分化表现出不同的反应。”
“在这项研究中,我们报告了一种在空间上解决DNA甲基化障碍基因组模式的方法[…]”
一篇新的研究论文发表在Aging(由MEDLINE/PubMed列为“Aging (Albany NY)”和“Aging- us”由Web of Science)第16卷第2期,题为“表观遗传漂移是表观遗传时钟信号的基础,但对寿命干预、发育和细胞去分化表现出不同的反应。”
DNA甲基化随年龄的变化可以在整个生命之树上观察到。这些变化的固有性质可以建模,以产生能够以前所未有的准确性预测实际年龄的表观遗传时钟。尽管表观遗传时钟的预测能力及其作为生物标志物在临床应用中的效用,但产生时钟信号的潜在过程尚未完全解决,这限制了它们的可解释性。
在这项新研究中,来自佐治亚大学的研究人员Emily M. Bertucci-Richter、Ethan P. Shealy和Benjamin B. Parrott开发了一种计算方法,从空间上解决DNA甲基化模式的内部变异或“紊乱”,并测试与年龄相关的DNA甲基化紊乱的变化是否构成表观遗传时钟信号的基础。
“在这里,我们应用新的基于阅读的策略来解决小鼠基因组中与年龄相关的表观遗传疾病。”
研究小组发现,表观遗传时钟位点在随着年龄增长而积聚和失去紊乱的区域中富集,这表明DNA甲基化紊乱和表观遗传时钟之间存在联系。然后,他们开发了基于DNA甲基化模式区域紊乱的表观遗传时钟,并通过研究发育、寿命干预和细胞去分化的影响,将其性能与其他表观遗传时钟进行了比较。研究人员确定了典型表观遗传时钟和基于区域紊乱的表观遗传时钟之间的共同反应以及关键差异,证明了表观遗传衰老过程的基本解耦。
“总的来说,我们确定了表观遗传疾病和表观遗传时钟之间的关键联系,并证明了表观遗传衰老的多面性,其中在非随机位点发生的随机过程产生了可预测的结果。”
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