靶向STAT3/NFKB1轴抑制铁死亡——BRD-K20733377治疗椎间盘退变的多机制研究

【字体: 时间:2025年10月01日 来源:Stem Cell Research & Therapy 7.3

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  本研究针对椎间盘退变(IVDD)引发的下腰痛难题,通过人工智能筛选获得具有抗衰老特性的化合物BRD-K20733377。研究人员综合运用网络药理学、生物信息学、机器学习、分子对接、分子动力学模拟和孟德尔随机化等多学科技术手段,结合体外细胞实验和大鼠模型验证,发现该化合物通过STAT3/NFKB1信号轴抑制铁死亡(ferroptosis),显著改善椎间盘退变进程。研究为IVDD治疗提供了新的潜在靶点和治疗策略,具有重要的临床转化价值。

  
在全球范围内,下腰痛已成为导致残疾的首要原因,约84%的人在一生中会经历这种痛苦,其中高达80%的患者会反复发作。椎间盘退变(intervertebral disc degeneration, IVDD)被认为是下腰痛的主要病因,全球超过40%的病例与之相关,给社会带来了沉重的经济负担。
椎间盘由三部分组成:中央的胶状髓核(nucleus pulposus, NP),周围的纤维环(annulus fibrosus, AF)和覆盖的终板(endplates, EP)。随着年龄增长、不健康生活方式和生物力学应力等因素的影响,NP组织从凝胶状态转变为纤维状态,导致II型胶原和聚集蛋白聚糖(aggrecan)等维持椎间盘完整性的关键成分减少,最终引发IVDD。
尽管研究人员对IVDD的机制进行了广泛探索,但其确切发病机制仍未完全阐明。近期研究表明,椎间盘内的炎症微环境是IVDD发展的关键因素。促炎介质水平的升高会触发一系列病理事件,包括活性氧(reactive oxygen species, ROS)的产生、细胞外基质(extracellular matrix, ECM)的降解以及多种程序性细胞死亡形式,如凋亡(apoptosis)、坏死性凋亡(necroptosis)和铁死亡(ferroptosis)。其中,铁死亡作为一种铁依赖性的脂质过氧化过程,在IVDD进展中扮演着重要角色。
铁死亡通过促进免疫细胞浸润加速IVDD进程。铁代谢紊乱和谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4, GPX4)功能障碍,通常由机械敏感的Piezo1通道激活触发,会进一步放大髓核细胞(nucleus pulposus cells, NPCs)的铁死亡,加剧椎间盘退化。目前IVDD的治疗药物如止痛药,主要侧重于症状缓解而非解决椎盘的结构和功能问题。鉴于新药开发成本高昂,从现有化合物库中筛选治疗IVDD的潜在候选药物成为一种可行策略。
2023年,Wong等人利用人工智能筛选了超过80万个分子,鉴定出三种小分子化合物:BRD-K20733377、BRD-K56819078和BRD-K44839765。AI预测这些化合物能够精准靶向抗衰老通路,随后的细胞和动物实验验证了这一预测。本研究通过生物信息学分析发现铁死亡在IVDD中起关键作用,并确定BRD-K20733377(BRD)作为调节IVDD铁死亡的潜在有效药物。
为了探究BRD在抑制铁死亡和缓解IVDD中的作用及机制,本研究采用网络药理学、生物信息学、机器学习算法、分子对接、分子动力学模拟和孟德尔随机化等多种策略。同时,选择大鼠髓核来源的间充质干细胞(nucleus pulposus-derived mesenchymal stem cells, NPMSCs)和Sprague-Dawley(SD)大鼠进行体内外实验,进一步验证研究发现。
研究主要运用了以下关键技术方法:通过网络药理学筛选BRD与IVDD铁死亡的共同靶点;采用机器学习算法(LASSO和随机森林)确定核心靶点STAT3和NFKB1;通过分子对接和分子动力学模拟验证BRD与靶点的结合能力;利用孟德尔随机化分析STAT3/NFKB1与IVDD的因果关系;使用体外细胞模型(NPMSCs)评估BRD对Erastin诱导铁死亡的影响;建立大鼠IVDD模型进行体内药效学评价。
铁死亡在NP组织中的验证
通过对不同Pfirrmann分级的人NP组织进行免疫组化分析发现,随着退变程度加重,铁死亡相关蛋白ACSL4表达显著上升,而FTH1、GPX4和SLC7A11表达显著下降。SD大鼠实验也观察到类似现象,退变组ACSL4表达增加,FTH1、GPX4和SLC7A11表达减少,证实铁死亡参与IVDD进程。
网络药理学分析
通过数据库挖掘获得BRD相关靶点465个、铁死亡相关靶点1225个、IVDD相关靶点1823个,取交集得到30个共同靶点。构建蛋白互作网络后,通过CytoNCA插件计算获得前10个核心靶点:NFE2L2、TNF、PARP1、STAT3、NFKB1、SIRT1、MTOR、IL6、CTNNB1和AKT1。
GO和KEGG富集分析显示,这些靶点主要富集在氧化应激诱导的内在凋亡信号通路调节、细胞对肽激素刺激的反应、小分子代谢过程调节等生物过程,以及人类巨细胞病毒感染、脂肪细胞因子信号通路、胰岛素抵抗等信号通路。
机器学习算法确定核心靶点
结合LASSO和随机森林两种机器学习算法,从10个核心基因中筛选出STAT3和NFKB1作为关键生物标志物。
分子对接与分子动力学模拟
分子对接显示BRD与NFKB1和STAT3的结合能分别为-7.0 kcal/mol和-7.4 kcal/mol,表明具有良好的结合亲和力。分子动力学模拟进一步证实BRD与这两个靶点的结合稳定性良好。
孟德尔随机化验证
通过孟德尔随机化分析发现STAT3和NFKB1与IVDD风险存在显著因果关系(IVW, OR=1.02, 95% CI=1.00-1.04, p=0.025; IVW, OR=1.09, 95% CI=1.00-1.19, p=0.043)。
BRD抑制Erastin诱导的NPMSCs铁死亡
CCK-8实验表明6μM BRD处理72小时对NPMSCs无显著细胞毒性作用。5μM Erastin可诱导NPMSCs铁死亡,而BRD预处理能显著改善这一现象。JC-1检测显示BRD处理可恢复线粒体膜电位;ROS检测表明BRD降低细胞内ROS水平;FerroOrange和Liperfluo染色显示BRD减少Fe2+含量和脂质过氧化物积累;电镜观察发现BRD改善线粒体形态;MDA检测表明BRD降低脂质过氧化水平。
Western blot和免疫荧光结果显示,Erastin处理使ACSL4表达升高,GPX4、FTH1和SLC7A11表达降低,而BRD处理可逆转这些蛋白的表达变化。
BRD调节大鼠疼痛样行为
体内实验显示,与PBS组相比,BRD组显著提高了大鼠尾基部手术部位的疼痛反应阈值(Von Frey test)。开阔场试验虽未达到统计学显著性,但BRD组大鼠表现出更高的平均速度、总运动距离和运动时间。
BRD有效预防大鼠IVDD模型
影像学评估显示,PBS注射组椎间盘高度指数(disc height index, DHI)显著降低,NP信号强度显著下降,Pfirrmann分级显著升高,而BRD治疗逆转了这些变化。大体标本分析表明,PBS组NP相对面积随时间推移逐渐减小,组织学评分逐渐升高,BRD处理逆转了这些变化。
组织学分析显示,BRD组IVDD进展显著减轻。SF染色显示BRD组保留更大的红色区域,表明胶原富集。免疫组化结果显示BRD组MMP13表达下调,COL-II表达上调。
铁死亡相关蛋白免疫组化显示,BRD组ACSL4表达低于PBS组,而FTH1、GPX4和SLC7A11表达高于PBS组,表明BRD在组织水平抑制铁死亡。
本研究首次揭示BRD-K20733377通过STAT3/NFKB1信号轴抑制铁死亡,从而缓解IVDD。研究证实了BRD-K20733377在Erastin诱导的NPMSCs中的抗铁死亡作用,并在大鼠IVDD模型中验证了其保护效果。研究结果表明,BRD-K20733377作为一种新型铁死亡抑制剂,在IVDD及其他铁死亡介导的疾病治疗中具有广阔的应用前景和转化价值。
研究的局限性包括:采用的急性尾椎间盘退变大鼠模型不能完全复制人类慢性IVDD的复杂性;人和大鼠在细胞类型和生物力学因素方面的差异可能限制对BRD临床应用的全面理解;研究进行的是短期实验,可能无法完全揭示BRD的长期效应和潜在副作用。未来研究应关注BRD对椎间盘退变的长期影响及其潜在耐药性或副作用,并利用更精细的分子生物学技术进一步探索BRD特异性调节这些信号通路的详细分子机制。
尽管存在这些局限性,本研究为IVDD的治疗提供了新的思路和潜在治疗靶点,为BRD-K20733377的临床应用奠定了理论基础。
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