新型5-氟尿嘧啶杂合物的设计与计算研究:作为胸苷酸合成酶抑制剂用于治疗非小细胞肺癌

《Computational and Theoretical Chemistry》:Designing and computational studies of Novel 5-Fluorouracil hybrids as thymidylate synthase inhibitors for targeting non small cell lung cancer

【字体: 时间:2025年10月03日 来源:Computational and Theoretical Chemistry 2.8

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  该研究通过计算化学方法设计并评估了5-氟尿嘧啶(5-FU)衍生物作为胸苷酸合成酶(TS)抑制剂的潜力,用于非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗。通过分子对接、自由能计算、质构分析(PCA)和分子动力学(MD)模拟,发现化合物C04、C08和C12的抑制效果优于标准药物拉替昔定(Raltitrexed),且所有设计化合物稳定性更高。这些结果为开发新型高效低毒的抗肺癌药物提供了理论依据。

  癌症是一种复杂的多因素疾病,其特征是细胞的无序增殖和调控机制的受损。在众多癌症类型中,非小细胞肺癌(NSCLC)仍然是全球范围内最常见且最具致命性的恶性肿瘤之一。面对这一挑战,科学家们正致力于开发能够降低细胞耐药性、提高治疗效果或防止DNA变异的新药。近年来,针对胸苷酸合成酶(TS)抑制剂的研究取得了显著进展,表明在NSCLC的治疗中,TS抑制剂能够以较低的不良反应实现有效的管理。因此,迫切需要更先进、高效且针对性更强的抗癌药物,以取代传统药物,提高治疗的安全性和效果。

本研究的主要目标是设计并评估基于5-氟尿嘧啶(5-FU)的新型分子结构,以期成为TS的潜在抑制剂。5-FU是目前最广泛使用的TS抑制剂之一,其作用机制主要是通过其代谢产物5-氟-2’-脱氧尿苷一磷酸(5-FdUMP)竞争性地结合TS的活性位点,从而阻断dTMP的合成。这一过程导致胸苷的缺乏,进而引发DNA损伤,最终促使快速增殖的肿瘤细胞发生凋亡。然而,5-FU在临床使用中也存在一些局限性,例如剂量依赖性的毒性反应,包括骨髓抑制、口腔黏膜炎和胃肠道紊乱等。此外,肿瘤细胞可能通过增加TS的表达、增强药物代谢或抑制药物活化途径等方式产生耐药性。这些限制促使研究人员探索新的分子结构,以克服传统药物的不足,提高治疗效果和选择性。

在此背景下,苯并噻唑(benzothiazole)骨架因其多种药理活性而受到关注。该结构不仅能够增强与TS的结合亲和力,还能改善药物的药代动力学特性,并可能克服传统TS抑制剂的耐药机制。苯并噻唑类化合物已被证实具有抗增殖、抗血管生成和促凋亡的作用,因此在NSCLC的治疗中展现出良好的应用前景。此外,某些苯并噻唑化合物对癌细胞具有选择性毒性,而对正常组织的损害较小,这使其成为开发新型抗癌药物的理想选择。

基于上述背景,本研究聚焦于开发新型5-FU与苯并噻唑的杂化分子,作为潜在的TS抑制剂,以期在NSCLC治疗中取得更好的效果。为了评估这些分子的潜在药效,我们采用了多种计算方法,包括分子对接、分子动力学(MD)模拟、MM-GBSA能量计算、定量构效关系(QSAR)建模、ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)预测、主成分分析(PCA)和自由能景观(FEL)映射。这些计算技术不仅能够提供分子与靶点之间的相互作用细节,还能预测药物的药代动力学行为和毒性,从而在药物开发的早期阶段筛选出最有前景的候选分子。

在分子对接研究中,我们对12种设计的5-FU杂化分子进行了详细的分析,以评估其与TS的结合能力。结果显示,化合物C04、C08和C12在结合能方面表现出更优的性能,其对接得分分别为-10.1、-10.1和-10.4 kcal/mol,优于已知的TS抑制剂如拉替替克(Raltitrexed)。这一结果表明,这些化合物可能比传统药物更有效地抑制TS,从而阻断DNA合成,提高NSCLC的治疗效果。同时,所有设计的化合物在稳定性方面也优于标准药物,这进一步增强了它们作为潜在治疗药物的可能性。

为了进一步验证这些化合物的潜在药效,我们进行了分子动力学模拟和QSAR建模。分子动力学模拟有助于了解化合物与TS之间的动态相互作用,而QSAR建模则能够预测化合物的生物活性与其化学结构之间的关系。这些研究不仅提供了分子结合的详细信息,还评估了化合物的药代动力学特性,如吸收、分布、代谢和排泄,以及潜在的毒性。通过这些分析,我们能够识别出具有最佳药物样特性的分子,并排除那些不符合要求的候选分子。

此外,主成分分析(PCA)和自由能景观(FEL)映射被用于增强研究的统计稳健性。PCA能够揭示分子在结合过程中的构象变化,而FEL映射则有助于识别分子在不同构象下的能量分布,从而评估其结合能力和稳定性。这些方法为药物设计提供了重要的理论支持,帮助研究人员更全面地理解化合物的结合行为和药效潜力。

本研究的成果表明,基于5-FU的苯并噻唑杂化分子在NSCLC治疗中具有广阔的应用前景。这些分子不仅能够有效抑制TS,还可能在减少不良反应和提高治疗选择性方面表现出优势。通过结合5-FU的已知机制与苯并噻唑的结构多样性,这些杂化分子有望成为NSCLC治疗的新选择,为患者提供更安全、更有效的治疗方案。

在实际应用中,尽管计算方法为药物开发提供了重要的指导,但实验验证仍然是不可或缺的环节。因此,本研究建议后续进行体外和体内实验,以进一步验证这些分子的药效和安全性。同时,考虑到药物开发的复杂性和高成本,计算方法的应用能够显著缩短研发周期,降低实验成本,并减少对实验动物的依赖,从而在伦理和经济层面都具有重要意义。

综上所述,针对NSCLC的治疗,TS是一个极具潜力的靶点。通过设计和评估新型的5-FU杂化分子,我们不仅能够探索更有效的抗癌策略,还能为未来的药物开发提供坚实的理论基础和实验指导。这一研究的成果将有助于推动NSCLC治疗领域的发展,为患者带来更多的治疗选择和更好的预后。
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