血府逐瘀汤中生物活性成分的鉴定及其在心室重构中的作用机制：网络药理学、分子对接和分子动力学模拟研究

《Current Pharmaceutical Design》：Identification of Bioactive Ingredients and Mechanistic Pathways of Xuefu Zhuyu Decoction in Ventricular Remodeling: A Network Pharmacology, Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulations

　　本研究通过网络药理学分析Xuefu Zhuyu Decoction（XFZYD）治疗心室重塑（VR）的活性成分及分子机制，筛选出1089个高吸收和成药性成分，发现538个共有靶点，其中10个核心靶点（AKT1、STAT3、TP53等）涉及PI3K-Akt信号通路、脂质代谢等，并通过分子对接和动力学模拟验证其相互作用稳定性，为临床应用提供科学依据。

　　

摘要

背景：血府逐瘀汤（XFZYD）在中国临床上被用于促进血液循环、消除血瘀以及缓解心室重构（VR）。然而，其分子机制尚不清楚。

目的：本研究探讨了XFZYD在治疗VR中的活性成分及其潜在的分子机制。

方法：确定了XFZYD活性成分的作用靶点以及与VR相关的靶点。构建了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和药物-成分-靶点网络，并通过GO功能注释和KEGG通路富集分析来探索其生物学功能。通过分子对接和分子动力学（MD）模拟验证了关键靶点及其对应的活性成分。

结果：共鉴定出1,089种具有高胃肠道吸收率（GI）和药物相似性（DL ≥ 2）的活性成分。XFZYD和VR共有538个共同靶点，其中包含10个核心靶点，即AKT1、STAT3、TP53、EGFR、SRC、TNF、MAPK3、CTNNB1、IL6和VEGFA。GO分析显示XFZYD对伤口愈合、氧应答、上皮细胞增殖和受体信号传导具有影响。KEGG分析突出了PI3K-Akt信号通路、脂质代谢和动脉粥样硬化以及流体剪切应力等关键通路。分子对接结果表明，这些活性成分与关键基因具有良好的相互作用，结合能介于-9.5至-6.0 kcal/mol之间。这些相互作用通过MD模拟得到了进一步验证，在100纳秒的模拟时间内表现出稳定的结合。

结论：XFZYD通过多种活性成分和通路发挥治疗效果，为其临床应用和进一步研究提供了科学依据。