EuroForMix在DNA混合图谱解卷积与证据权重计算中的效能评估:法医遗传学混合分析新工具的比较研究
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时间:2025年10月04日
来源:Forensic Science, Medicine and Pathology 1.5
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本研究针对法医DNA混合分析中因降解或低模板样本带来的随机效应与人为干扰等挑战,重新评估了EuroForMix(EFM)软件在解卷积与证据权重(LR)计算中的表现。通过对巴西联邦警察2022年两起真实案件样本的再分析,发现EFM在LR计算与主要贡献者基因型推断方面优于传统工具(LRmix Studio、GeneMapper? ID-X及实验室验证表格),显著提升证据解释的准确性与效率,为复杂DNA混合物的法医鉴定提供了更可靠的定量分析方案。
在犯罪现场,生物样本往往包含多个个体的DNA混合物,这给法医鉴定带来了巨大挑战。尤其是在处理降解或低含量的DNA样本时,随机效应(stochastic effects)和技术伪迹(artifacts)会进一步增加分析的复杂性。传统的DNA混合分析方法高度依赖分析人员的主观判断,且在处理低模板或复杂混合物时表现不稳定。随着犯罪样本类型的多样化(如接触DNA、枪支拭子等),混合图谱的出现频率显著上升,这使得发展更客观、更精确的分析方法成为法医遗传学领域的迫切需求。
在此背景下, probabilistic genotyping(概率分型)和 continuous model(连续模型)方法逐渐成为解决复杂DNA混合分析的关键工具。它们能够通过数学模型定量评估证据的强度,并计算似然比(Likelihood Ratio, LR),从而为法庭提供更具说服力的科学证据。EuroForMix(EFM)便是其中一款基于连续模型的开放源代码软件,它整合了混合图谱解卷积(deconvolution)和证据权重计算功能,旨在提升分析效率和结果的可重复性。
本研究由巴西联邦警察国家犯罪学研究所DNA法庭实验室的研究团队开展,研究论文发表在《Forensic Science, Medicine and Pathology》。研究团队重新分析了两起2022年由该实验室处理的真实案件中的DNA样本,旨在评估EFM在解卷积和LR计算中的表现,并与之前采用的LRmix Studio、GeneMapper? ID-X和实验室内部验证的电子表格方法进行系统比较。
为开展本研究,团队主要运用了以下关键技术方法:首先,采用PowerPlex? Fusion 6C试剂盒进行STR扩增,使用毛细管电泳技术获取DNA图谱;其次,利用EuroForMix v.3.4.0进行混合图谱解卷积与LR计算,参数设置包括FST校正值0.02、drop-in概率0.0005、stutter比例先验分布为dbeta(x,1,1)等;此外,分析中纳入了降解模型与stutter(前后向)效应,LR计算采用“Optimal Quantitative LR”模型,模型验证显著性水平设为0.01,并基于巴西国家DNA数据库推荐的等位基因频率进行计算(SE33基因座除外)。
案件涉及警方行动中平民死亡事件,采集了车辆后舱中的5处生物痕迹(Q1-Q5)及受害者参考样本(ref1)。结果显示,Q2与Q3为单一男性个体分型,Q3与ref1匹配;Q1、Q4、Q5为混合图谱,其中Q1的次要组分与ref1共享等位基因。使用EFM重新计算Q1和Q3的LR值,并与之前LRmix Studio和实验室表格的结果对比。EFM在Q1中计算出LR为1.465×1023,显著高于LRmix Studio的6.969×1013;Q3的LR与实验室表格结果一致。此外,对Q4和Q5进行解卷积分析,EFM与GeneMapper? ID-X在主要贡献者基因型推断上基本一致,仅FGA基因座在Q4中存在ID-X结果不明确而EFM明确的情况。
该案件涉及三辆弃置车辆中的32处生物样本,本研究聚焦其中8处关键样本(Q1、Q3、Q6、Q7、Q15、Q18、Q19、Q29)及两名嫌疑人参考样本(ref2、ref3)。先前分析中,多数样本采用实验室表格计算LR,Q29采用LRmix Studio,混合图谱解卷积使用GeneMapper? ID-X。EFM重新分析后,所有样本的LR值均有显著提升,例如Q1|ref2的LR从3.593×1010提升至2.789×1021,Q7|ref2从2.380×1021提升至2.449×1026。解卷积方面,EFM在多数样本中推断出更完整的基因型,特别是在贡献者比例均衡的混合样本(如Q1)中,ID-X未能明确主要贡献者基因型,而EFM通过假设Hd下的Top Marginal表估计实现了更高分辨率的推断。
研究结论与讨论部分强调,EFM在DNA混合分析中展现出高效、一致且更优的解析能力。其优势主要体现在三方面:一是在LR计算中能有效整合stutter、drop-in/drop-out等效应,提升证据权重强度;二是在解卷积中通过定量模型减少主观性,尤其适用于不平衡混合样本;三是软件一体化操作减少了人工录入错误,提高了分析效率。然而,研究也指出EFM目前尚不支持amelogenin(性别基因座)解卷积,且审计数据记录不够完善,需进一步优化。
本研究的意义在于为法医实验室提供了一种经过实战验证的、可靠的DNA混合分析工具。EFM不仅适用于常规案件,对低模板、降解样本及复杂混合物的处理表现尤为突出。此外,该研究强调,尽管软件工具极大提升了分析效率与准确性,最终结果仍需由经验丰富的分析人员结合案件背景进行综合判断。未来,需开展更多统计验证与敏感性研究,以进一步确立EFM在不同情境下的适用性与可靠性。
总之,这项研究通过真实案例的再分析,证实了EuroForMix在法医DNA混合解卷积与证据权重计算中的显著优势,为全球法医遗传学实验室提供了重要的方法学参考,并推动了DNA证据解释向更客观、更透明的方向发展。
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