基于分子对接与动力学的抗镰状细胞病先导化合物设计及Hba靶点机制研究
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时间:2025年10月04日
来源:In Silico Pharmacology
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本研究针对全球约1500万患者的镰状细胞病(SCD),通过计算机辅助药物设计手段开发新型Hba靶向抑制剂。研究人员采用分子对接、药代动力学评估、同源建模及分子动力学(MD)模拟等技术,构建出高预测性QSAR模型(R2=0.990, R2pred=0.980, Q2CV=0.987),设计出具有显著抗SCD活性的分子DM1-3(pIC50 6.671-6.912),其药物评分(0.56-0.91)优于对照TM/SD,MD模拟证实DM3-蛋白复合物结合自由能更高,稳定性优异。
镰状细胞病(Sickle Cell Disease, SCD)作为一种影响全球约1500万人的常见遗传性多器官疾病,其治疗关键在于发现能结合血红蛋白并调节氧合状态的药物。本研究通过计算生物学方法,开展针对Hba蛋白的计算机辅助药物设计,整合分子对接(Molecular Docking)、药代动力学评估(Pharmacokinetic Assessment)、同源建模(Homology Modeling)和分子动力学(Molecular Dynamics, MD)模拟等技术。所构建的定量构效关系(QSAR)模型展现出卓越的预测能力(R2=0.990, R2pred=0.980, Q2CV=0.987),符合国际标准模型规范。设计分子DM1、DM2和DM3显示预测生物学活性(pIC50)分别为6.843、6.671和6.912,显著优于对照分子TM(5.403)和SD(4.956)。这些分子同时具备更优的药物评分(DM1:0.67, DM2:0.56, DM3:0.91 vs TM:0.44, SD:0.49),表明其药代动力学特性更具优势。分子动力学模拟进一步揭示DM3与蛋白复合物的结合自由能高于蛋白-L-谷氨酸复合物,证实其具有更高的结构稳定性。
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