基于机器学习与细胞外囊泡多分析物血液指纹的胶质母细胞瘤精准监测新策略

【字体: 时间:2025年10月04日 来源:Neuro-Oncology 13.4

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  为区分胶质母细胞瘤(GBM)真性进展与假性进展,研究人员开展基于细胞外囊泡(EVs)的多组学液体活检研究,通过机器学习整合蛋白质与sRNA特征构建预测模型,验证准确率达89.9%-93.4%,为GBM无创监测提供新工具。

  
胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是成人中最具侵袭性的原发性脑肿瘤,尽管接受标准治疗,仍面临高复发率和低生存率的严峻挑战。临床上,区分真正的肿瘤进展与治疗相关效应(如假性进展)始终是一项棘手的难题。传统的影像学检查往往难以准确判断,而反复进行脑部活检又具有创伤性和高风险。因此,开发一种早期、可靠且无创的监测方法,能够实时反映肿瘤动态,对于指导治疗决策和改善患者预后具有迫切需求。
近年来,液体活检技术的兴起为肿瘤监测提供了新思路。其中,细胞外囊泡(Extracellular Vesicles, EVs)作为一种由细胞分泌的亚微米级(30-1000 nm)颗粒,因其能够穿越血脑屏障,并携带来源细胞的特异性分子信息(如蛋白质和RNA),被视为脑肿瘤液体活检的理想生物标志物来源。它们易于从血液等体液中分离,为实现无创、动态的肿瘤监测提供了可能。
在此背景下,由S.M. Hall等人组成的研究团队开展了一项创新性研究,旨在开发一种基于EVs的多分析物液体活检平台,通过机器学习技术挖掘血液中的分子“指纹”,以实现对GBM肿瘤负荷、复发及治疗抵抗的精准分类。该研究发表于知名期刊《Neuro-Oncology》。
研究团队为开展此项工作,主要应用了以下几项关键技术方法:收集了50例IDH野生型GBM患者在三个临床时间点(术前、术后和病理证实复发时)的104份系列血浆样本;采用标准化流程分离血浆中的EVs;运用互补的高通量蛋白质组学和小RNA(sRNA)测序技术对EV内容物进行分析;通过30次迭代的交叉验证流程(80%训练集,20%测试集),结合多种特征选择策略和分类算法进行数据建模;最终利用集成堆叠(ensemble stacking)机器学习方法构建多分析物预测模型。
研究结果
数据生成与特征筛选
通过对所有血浆样本的分析,研究团队共鉴定出4117种蛋白质和272种sRNA转录本 common to all samples(共有的)。经过数据预处理(过滤与标准化)后,利用机器学习流程从海量数据中筛选出最具信息量的蛋白质和sRNA生物标志物。
多分析物血液指纹模型的构建与性能
研究成功构建了三个特定的多分析物“血液指纹”预测模型:
  1. 1.
    肿瘤负荷分类模型(PreOP vs. PostOP):用于区分术前(存在肿瘤)和术后(肿瘤切除后)状态。
  2. 2.
    复发分类模型(PostOP vs. REC):用于区分术后无瘤状态与病理证实的复发状态。
  3. 3.
    治疗抵抗分类模型(PreOP vs. REC):用于区分初治肿瘤与复发肿瘤(可能涉及治疗抵抗)。
每个模型都整合了筛选出的最有效的蛋白质和sRNA特征。所有模型在训练集上均达到了100%的准确率,并且在交叉验证中表现出稳健的性能。在独立测试集上,三个模型的准确率分别达到89.9%至93.4%的高水平,展现出优异的泛化能力和临床应用的潜力。
研究结论与意义
该研究证实了基于EVs的多分析物液体活检在GBM无创监测中的可行性与巨大临床潜力。这种创新方法能够从单次抽血中获取丰富的分子信息,通过机器学习算法转化为高精度的预测模型,为临床医生提供了除影像学之外的新型血液学生物标志物工具。
其重要意义在于:首先,它有望解决GBM管理中的关键挑战——准确区分肿瘤真性进展与假性进展,从而避免不必要的治疗调整或 invasive 手术。其次,该方法能够动态监测治疗反应和肿瘤演化,为个体化治疗方案的制定提供实时依据。最后,研究中所开发的机器学习驱动平台具有良好的通用性,为其他肿瘤类型的液体活检研究提供了可借鉴的范式。
目前,研究团队正在利用来自VERTU临床试验(ACTRN12615000407594)和悉尼脑肿瘤库(Sydney Brain Tumour Bank)的更多血浆样本和临床病理数据对模型进行进一步验证,旨在推动这一液体活检策略走向临床实施,最终改善GBM患者的生存和管理质量。这项研究标志着脑肿瘤精准医疗向无创、动态和智能化方向迈出了重要一步。
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