胶质瘤细胞衰老关键基因改变及其与肿瘤级别的关联分析

【字体: 时间:2025年10月04日 来源:Neuro-Oncology 13.4

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  本研究针对胶质瘤治疗反应差、易复发的临床难题,通过分析eBioPortal数据库中3425例样本,系统解析了88个衰老相关基因(SASP)的变异特征。研究发现TP53、CDKN2A、EGFR等10个关键基因在高级别胶质瘤(HGG)中变异频率显著更高,首次揭示不同级别胶质瘤的特异性基因改变模式,为靶向衰老通路的新型治疗策略提供重要依据。

  
在大脑的神秘疆域中,胶质瘤作为最常见的中枢神经系统原发性肿瘤,始终是神经肿瘤领域的治疗难点。这类肿瘤不仅具有高度侵袭性的生物学特性,更令人困扰的是其在常规治疗后极易复发,导致患者预后普遍较差。近年来,科学家们将目光投向了一个特殊的细胞状态——细胞衰老(Cellular Senescence)。这种细胞永久性退出细胞周期的过程,犹如给细胞按下了"暂停键",在肿瘤发生发展中扮演着双重角色:既可能抑制肿瘤进展,又可能通过衰老相关分泌表型(SASP)重塑肿瘤微环境。然而,关于胶质瘤中细胞衰老相关基因的变异全景图,至今仍缺乏系统性的研究。
为了解决这一科学问题,来自克罗地萨格勒布大学医学院的研究团队开展了一项大规模生物信息学研究,成果发表在《Neuro-Oncology》期刊。研究人员利用癌症基因组学权威数据库eBioPortal,对3425例胶质瘤样本进行了深入挖掘。他们首先筛选出88个与SASP相关的基因,进而聚焦其中变异频率最高的10个关键基因:TP53、CDKN2A、EGFR、ATM、TNFRSF1A、IGFBP7、TNFRSF11B、TP53BP1、HGF和SERPINE1。通过系统分析这些基因在不同级别胶质瘤中的突变、扩增和缺失情况,揭示了胶质瘤级别与特定基因改变之间的内在联系。
研究采用生物信息学分析方法,对eBioPortal公共数据库中的3425例胶质瘤样本进行挖掘,重点分析10个SASP相关基因(TP53、CDKN2A、EGFR、ATM、TNFRSF1A、IGFBP7、TNFRSF11B、TP53BP1、HGF、SERPINE1)的变异频率和类型,包括突变、扩增、缺失等遗传改变,采用统计学方法比较高级别(HGG)和低级别胶质瘤(LGG)的差异。
研究结果
通过大样本数据分析发现,TP53、CDKN2A和EGFR是胶质瘤中变异频率最高的基因。进一步分级比较显示,CDKN2A、EGFR、ATM、IGFBP7、TP53BP1和HGF在高级别胶质瘤(HGG)中的改变比例更高,而TP53、TNFRSF1A、TNFRSF11B和SERPINE1则在低级别胶质瘤(LGG)中更常发生变异。特别值得注意的是,TP53、CDKN2A、EGFR、IGFBP7和TNFRSF11B这五个基因在HGG和LGG组间表现出统计学显著差异。
结论与讨论
本研究首次系统描绘了胶质瘤中细胞衰老相关基因的变异图谱,证实这些基因的改变频率与肿瘤级别密切相关。研究发现高级别胶质瘤具有更频繁的特定基因改变,这一发现不仅深化了对胶质瘤分子发病机制的理解,更重要的是为开发新的治疗策略提供了方向。针对这些衰老相关基因的靶向干预,可能成为克服胶质瘤治疗抵抗和复发的新途径。该研究建立的基因变异与肿瘤级别的关联模型,还有助于完善胶质瘤的分子分型体系,为未来个体化治疗方案的制定提供重要参考依据。
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