圣罗勒黄酮类化合物通过分子对接与密度泛函理论研究靶向COX-2酶的抗炎机制
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时间:2025年10月08日
来源:Biophysical Chemistry 2.2
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本研究通过分子对接和密度泛函理论(DFT)计算,揭示圣罗勒植物中黄酮类化合物(如鼠李素、木犀草素等)作为COX-2(环氧化酶-2)选择性抑制剂的抗炎潜力。研究结合ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)预测与Lipinski五规则筛选,证实这些天然化合物具有优于Celecoxib(塞来昔布)的结合亲和力和电子特性,为开发神经炎症(如阿尔茨海默病)的天然疗法提供新思路。
COX-2(环氧化酶-2)的晶体结构(分辨率2.80 ?)从蛋白质数据库(PDB ID: 6COX)中获取,其中包含天然配体S58化合物。使用UCSF Chimera(版本1.17.3)对受体蛋白进行预处理:移除所有水分子、杂原子及天然配体,仅保留蛋白的A链用于对接分析。能量最小化处理旨在优化蛋白结构,确保其构象稳定性。
ADMET properties prediction
通过ADMETlab 2.0计算的理化及药用性质见表1。表注展示了配体被认可为药物时各参数的允许范围。所有化合物的分子量均介于150–450 g/mol之间,符合口服药物likeness的指导原则——特别是Lipinski五规则。此外,这些化合物表现出良好的肠道吸收特性、血脑屏障穿透能力以及较低的肝毒性和心脏毒性风险,凸显其作为候选药物的潜力。
本研究通过分子对接技术筛选出来自圣罗勒植物的四种具有抗炎潜力的化合物。这些化合物满足多数关键理化性质与ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)标准。分子对接分析揭示了这些化合物与COX-2酶的结合模式,其结合亲和力均优于Celecoxib(塞来昔布)。密度泛函理论(DFT)计算进一步证实了这些化合物的电子特性与稳定性,为其抗炎机制提供了理论支持。
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