宏基因组下一代测序揭示念珠菌血症预后微生物协同作用并指导精准治疗：一项回顾性队列研究

　　本文推荐mNGS（宏基因组下一代测序）在念珠菌血症管理中的突破性价值：通过快速病原检测实现早期风险分层（SOFA评分和共感染谱），细菌共感染使死亡风险倍增（HR=2.00）；mNGS指导初始抗真菌治疗可降低52.4%死亡率，为精准干预提供新范式。

　　

研究背景与目的

念珠菌血症作为医疗相关侵袭性真菌病，死亡率高达25%-50%。传统血培养灵敏度有限（50%-75%），诊断延迟导致错过关键治疗窗口。宏基因组下一代测序（mNGS）技术能够24小时内检测超过1万种病原体，但其在念珠菌血症预后评估和治疗指导中的价值尚未明确。本研究通过回顾性队列分析，旨在探索mNGS在念珠菌血症中的预后预测能力及临床干预效果。

研究方法

研究纳入四川大学华西医院2020-2024年97例血mNGS阳性念珠菌血症患者。通过多变量逻辑回归和生存分析识别死亡预测因子，并评估mNGS结果对抗真菌治疗方案调整的影响。统计学分析采用LASSO回归筛选变量，Kaplan-Meier曲线进行生存分析。

结果分析

微生物共感染模式与诊断优势

mNGS较血培养展现出显著诊断优势：识别念珠菌物种数量更多（5种 vs 4种），其中白色念珠菌检测量提高5倍（41例 vs 3例），并独特检出光滑念珠菌和中间念珠菌。共感染分析显示，细菌共感染（59/97）与死亡风险显著相关（HR=2.00），特别是肺炎克雷伯菌（22.7%）和鲍曼不动杆菌（21.6%）。真菌共感染中曲霉菌（77.8%死亡率）、耶氏肺孢子菌和毛霉菌（均100%死亡率）提示预后不良。

死亡风险预测因素

LASSO回归筛选出7个预测变量，其中序贯器官衰竭评估（SOFA）评分是最强独立预测因子（调整后OR=1.29/分）。中心静脉导管拔除显示与死亡率关联（未调整OR=8.50），但经SOFA评分校正后显著性减弱。值得注意的是，念珠菌特异性读长数与死亡率无显著相关性，提示mNGS读长数不宜作为独立预后指标。

治疗干预效果

在未接受抗真菌治疗的患者中，基于mNGS结果启动治疗使28天死亡率从75.0%降至22.6%（p<0.05）。然而，对已治疗患者调整方案未显现生存获益（43.8% vs 55.3%），可能因干预时机过晚或存在耐药性。

生存模式分析

不同念珠菌物种（白色念珠菌、近平滑念珠菌等）间生存率无显著差异，表明其毒力相当。但细菌共感染患者生存期显著缩短，凸显微生物协同作用在疾病进展中的关键地位。

讨论与展望

本研究首次系统阐述mNGS在念珠菌血症预后分层和治疗指导中的双重价值。技术优势体现在早期识别高危共感染组合（如细菌-真菌协同作用），而SOFA评分作为宿主因素核心指标，强化了器官功能状态对预后的主导影响。治疗时间窗分析提示mNGS指导的早期干预具有最大临床收益。未来需通过前瞻性研究验证标准化mNGS流程，并探索动态监测在疗效评估中的应用。

结论

mNGS通过微生物协同作用识别、SOFA评分整合及精准治疗指导，重塑念珠菌血症管理范式。其快速病原检测能力为高危患者提供个性化干预契机，有望成为脓毒症精准医疗的关键工具。