MUTYH介导的8-氧代鸟嘌呤诱发"远距离突变"机制及其与APOBEC特征关联性研究

《Genes and Environment》:Action-at-a-distance mutations by 8-oxo-7,8-dihydroguanine: adenine pair triggered by MUTYH

【字体: 时间:2025年10月17日 来源:Genes and Environment 1.9

编辑推荐:

  本研究针对8-氧代鸟嘌呤(GO)不仅在其损伤位点诱发G:C→T:A颠换,还能通过碱基切除修复(BER)途径引发"远距离突变"的现象展开深入探索。研究人员通过构建携带GO:A错配的质粒系统,在人骨肉瘤U2OS细胞模型中证实了MUTYH糖苷酶在切除未受损腺嘌呤(A)过程中触发了5'-TpC-3'位点的特征性突变,且该突变谱与APOBEC特征(SBS2/SBS13)高度吻合。这一发现揭示了DNA修复酶在抑制位点特异性突变的同时可能引发周边突变的"糖苷酶悖论"现象,为理解氧化损伤相关的致癌机制提供了新的视角。

  
在细胞这场永不停息的DNA保卫战中,8-氧代-7,8-二氢鸟嘌呤(8-oxo-7,8-dihydroguanine, GO)可谓是一位"双面间谍"。作为活性氧(ROS)攻击的主要产物,它既能直接在损伤位点引发G:C→T:A颠换突变(对应SBS18特征),又能在被修复过程中神秘地诱发"远距离突变"——在损伤位点之外的基因组区域产生新的突变。这种看似矛盾的现象引发了科学家的浓厚兴趣:为什么修复系统在清除损伤的同时,会意外打开潘多拉魔盒?
以往研究主要关注GO:C配对通过OGG1糖苷酶触发的突变机制,而GO:A这一同样重要的损伤形式却鲜有关注。当DNA聚合酶将dATP错误掺入 opposite GO,或直接将氧化的dGOTP掺入 opposite A时,就会形成GO:A错配。正常情况下,专门针对此类错配的MUTYH糖苷酶会切除未受损的A碱基,为正确修复提供机会。但福岛等人敏锐地意识到,这个修复过程本身可能成为新的突变源头。
为验证这一假说,研究团队构建了精巧的分子工具——携带特异性GO:A错配的pSB146KL-29T-BC(D12)穿梭质粒系统。该质粒的supF报告基因第29位被精心设计为突变监测点,其所在的预tRNA区域允许一定程度序列编辑而不影响基因功能,为高效检测周边突变提供了理想平台。
关键技术方法包括:通过RNA干扰实现MUTYH基因的特异性敲低;利用含有GO的寡核苷酸链构建位点特异性损伤质粒;采用PCR-RFLP和Sanger测序结合EditR软件分析位点29的碱基配对状态;通过细菌转化和序列分析统计supF突变频率及突变谱。
研究结果
MUTYH敲低有效抑制GO:A修复
通过Western blot验证,针对MUTYH的siRNA在质粒转染期间(24小时)到提取期间(72小时)均保持高效敲低效果(52%-75%)。PCR-RFLP和测序分析显示,GO:A质粒在对照组细胞中约有26%被修复为G:C配对,而在MUTYH敲低细胞中这一比例升至47%,证明MUTYH确实参与了GO:A的修复过程。
GO:A显著提升突变频率且依赖MUTYH
supF突变频率分析显示,GO:A质粒的突变频率达到G:C对照组的3.4倍,而普通G:A错配并未引起明显增加。更重要的是,MUTYH敲低使GO:A的突变频率降至接近背景水平,明确表明该效应依赖于MUTYH活性。
突变谱分析揭示5'-TpC-3'特异性靶向
深入突变谱分析发现,GO:A诱导的突变主要集中在GO链的5'-TpC-3'二核苷酸序列上,这与GO:C诱导的5'-GpA-3'突变形成鲜明对比。计算得到的5'-TpC-3'替换频率(FTpC)在GO:A组比G:C组高出10倍,而MUTYH敲低使其降低74%。
值得注意的是,82%携带5'-TpC-3'突变的质粒在位点29保持G:C配对,这与MUTYH切除A后经正确修复的预期完全吻合。且多数突变质粒携带多个5'-TpC-3'位点同时突变,发生频率远超泊松分布预期,提示这些突变可能是在单次事件中集中产生。
讨论与结论
本研究首次证实了GO:A错配通过MUTYH介导的碱基切除触发"远距离突变"的分子机制。与OGG1处理GO:C时切割GO链不同,MUTYH切割的是A链,这导致暴露的单链区域及其序列方向完全相反,完美解释了为什么GO:A特异性靶向5'-TpC-3'而非5'-GpA-3'。
研究结果支持如图1所示的统一机制模型:各种DNA糖苷酶(MUTYH、OGG1、UNG2等)在启动BER修复时,产生的切口会被修复蛋白识别,导致互补链暂时性单链暴露。这些暴露区域成为APOBEC3家族胞苷脱氨酶的理想底物,特别是在5'-TpC-3'背景下,最终通过碱基错配或脱碱基位点诱导突变。
这一"糖苷酶悖论"现象揭示了细胞防御系统的内在矛盾:旨在保护基因组的修复机制,在特定条件下反而成为突变驱动者。特别值得注意的是,与OGG1和NEIL1在GO:C修复中的功能重叠不同,MUTYH似乎是GO:A修复的唯一糖苷酶,这解释了为什么其敲低效果如此显著。
从更广阔的视角看,这项研究为理解内源性突变特征提供了重要线索。当细胞通过MutT/MTH1等酶类防止dGOTP掺入失败时,形成的GO:A不仅可能直接导致A:T→C:G颠换,还会通过这里揭示的机制贡献于APOBEC特征(SBS2/SBS13)。这种修复系统与突变特征之间的微妙平衡,可能在癌症进化、衰老过程中发挥着尚未被充分认识的重要作用。
该论文发表于《Genes and Environment》期刊,为氧化损伤相关突变机制研究增添了新的维度,也为开发针对特定突变特征的治疗策略提供了理论基础。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号