对古根菌（Archaeorhizomycetes）进行的短读长读序列宏条形码分析揭示了其极高的系统发育多样性，这种多样性受到植被和气候因素的调控

《New Phytologist》：Short- and long-read metabarcoding of Archaeorhizomycetes reveals high phylogenetic diversity structured by vegetation and climate

　　真菌生态与测序技术研究

　　

摘要

• 古菌根菌（Archaeorhizomycetes）是一类广泛分布于全球土壤中的真菌，最初被认为与植物根系有关，但其生态学特征和营养方式尚未得到明确界定。为了增进对古菌根菌生态学和生物地理学的了解，我们研究了它们在主要环境梯度以及不同土壤类型中的分布情况。
• 为了评估其丰度和多样性，我们采用了短读长序列（short-read long-sequence）和长读长序列（long-read long-sequence）的宏条形码技术，并使用了针对特定类别的引物。
• 短读长序列分析显示，古菌根菌在高山植被类型以及北方云杉和松树林中占比较高，是优势真菌类群。长读长序列分析揭示了古菌根菌的高度系统发育多样性，共有120个操作分类单元（OTUs）分为13个支系，这些支系可能具有不同的生态学特征和生物地理分布。植被类型和气候是影响古菌根菌群落结构的主要因素，而枯落物、土壤和根系中的古菌根菌组成相似。然而，古菌根菌在土壤和植物根系中的丰度显著高于枯落物中的丰度，这支持了古菌根菌依赖于植物根系存在的观点。
• 我们的研究表明，针对特定类群的扩增技术与长读长序列分析相结合，是探索特定真菌类群多样性和生态学的有效方法。