基于多元回归和主成分分析（PCA）的柑橘溃疡病流行病学研究方法

《Applied Fruit Science》：Multiple Regression and PCA Based Approach for Epidemiology of Citrus Canker

　　柑橘细菌性溃疡病的病原菌变异与环境因素关系研究，采用九个分离株进行体外接种试验，叶针刺接种法潜伏期最短（4.18天）。环境适宜温度25-35℃，湿度＞80%，发现八月病情最重且与温度、湿度和降雨量显著相关（贡献率90.48%和80.51%），PCA和聚类分析显示多雨月份（6-9月）为高风险期。

　　

摘要

Xanthomonas citri subsp. citri 是导致柑橘细菌性溃疡病的病原体，这是柑橘属（Citrus）植物的主要病害。为了研究该细菌在流行病学因素方面的变异性，研究人员从亚热带地区的不同柑橘品种中收集了9个病原体分离株，并对其进行了体外（in vitro）研究，以探讨其流行病学特征以及该疾病的传播情况。同时，还对 Citrus aurantifolia（K. lime）苗圃进行了定期观察。研究结果表明，该细菌在流行病学因素方面存在显著变异。叶片针刺接种法是最佳的接种方法，其培养周期最短（4.18天）；在体外条件下，25–35°C的温度和80%以上的相对湿度有利于疾病的发展。2021年6月至2023年5月期间，我们对位于尼里（Hamirpur）园艺与林业学院的 Citrus aurantifolia 苗圃进行了定期监测，发现8月份的柑橘溃疡病发病率较高，这一现象与月平均温度、相对湿度和月累计降雨量存在显著正相关。这些因素分别对疾病的发生率和严重程度产生了90.48%和80.51%的影响。主成分分析（PCA）和聚类分析（cluster analysis）揭示了两个主要因素（PC1和PC2），它们解释了91.55%的变异情况，其中6月至9月的雨季被认为是疾病高发期。