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通过对外周血转录组进行综合生物信息学分析,发现了精神分裂症与代谢综合征共病背后的共同分子特征
《Journal of Molecular Neuroscience》:Integrated Bioinformatics Analyses of Peripheral Blood Transcriptomes Reveals Shared Molecular Features Underlying the Comorbidity of Schizophrenia and Metabolic Syndrome
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年11月19日 来源:Journal of Molecular Neuroscience 2.7
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精神分裂症与代谢综合征共享免疫炎症相关基因模块,PGLYRP1为核心靶点,卡贝特林显示潜在治疗作用。
精神分裂症(SCZ)患者患代谢综合征(MetS)的比率显著较高,这表明这两种疾病之间存在潜在的生物学关联。然而,这种共病背后的分子机制仍不清楚。本研究旨在通过整合生物信息学分析来识别SCZ和MetS之间的共同分子特征。我们从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获取了SCZ(GSE38481)和MetS(GSE145412)的外周血转录组数据集。使用limma包识别SCZ的差异表达基因(DEGs),使用DESeq2识别MetS的差异表达基因。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)来识别与疾病相关的基因模块。利用Metascape对模块基因进行功能富集分析。通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape中的cytoHubba插件识别枢纽基因。采用基因集富集分析(GSEA)来探索这两种疾病中核心枢纽基因的生物学功能。利用连通性图谱(CMap)预测潜在的治疗靶点,并通过CB-Dock2进行分子对接验证。我们的分析通过WGCNA识别出一个与SCZ相关的基因模块和三个与MetS相关的基因模块。共有48个基因在这两个疾病相关的模块中存在交集,这些基因主要富集在免疫和炎症相关通路中。PPI网络分析显示PGLYRP1是一个核心枢纽基因,与两种疾病的免疫失调、代谢异常和神经功能障碍有关。CMap分析预测了几种能够逆转以PGLYRP1为中心的共病基因表达模式的候选化合物,随后的分子对接显示carbetocin对PGLYRP1的结合亲和力最高。总之,免疫和炎症过程在SCZ-MetS共病的病理生理学中起着关键作用。PGLYRP1可能成为这种共病的核心分子靶点,而carbetocin作为一种候选治疗药物显示出潜力,为未来的实验验证和潜在临床应用提供了理论基础。
精神分裂症(SCZ)患者患代谢综合征(MetS)的比率显著较高,这表明这两种疾病之间存在潜在的生物学关联。然而,这种共病背后的分子机制仍不清楚。本研究旨在通过整合生物信息学分析来识别SCZ和MetS之间的共同分子特征。我们从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获取了SCZ(GSE38481)和MetS(GSE145412)的外周血转录组数据集。使用limma包识别SCZ的差异表达基因(DEGs),使用DESeq2识别MetS的差异表达基因。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)来识别与疾病相关的基因模块。利用Metascape对模块基因进行功能富集分析。通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape中的cytoHubba插件识别枢纽基因。采用基因集富集分析(GSEA)来探索这两种疾病中核心枢纽基因的生物学功能。利用连通性图谱(CMap)预测潜在的治疗靶点,并通过CB-Dock2进行分子对接验证。我们的分析通过WGCNA识别出一个与SCZ相关的基因模块和三个与MetS相关的基因模块。共有48个基因在这两个疾病相关的模块中存在交集,这些基因主要富集在免疫和炎症相关通路中。PPI网络分析显示PGLYRP1是一个核心枢纽基因,与两种疾病的免疫失调、代谢异常和神经功能障碍有关。CMap分析预测了几种能够逆转以PGLYRP1为中心的共病基因表达模式的候选化合物,随后的分子对接显示carbetocin对PGLYRP1的结合亲和力最高。总之,免疫和炎症过程在SCZ-MetS共病的病理生理学中起着关键作用。PGLYRP1可能成为这种共病的核心分子靶点,而carbetocin作为一种候选治疗药物显示出潜力,为未来的实验验证和潜在临床应用提供了理论基础。
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