西格尼岛(南极海洋性南极洲)土壤与苔藓真菌分子鉴定揭示南极真菌多样性及其生态意义

《Polar Biology》:Molecular identification of fungi from soils and mosses of Signy Island (Maritime Antarctica)

【字体: 时间:2025年11月25日 来源:Polar Biology 1.6

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  本研究针对南极极端环境下真菌多样性认知不足的问题,对西格尼岛土壤与苔藓样本进行分子鉴定。通过ITS区域测序分析,成功鉴定出7属61株真菌,优势菌为Penicillium citrinum(47.54%)和Fusarium fujikuroi(29.50%)。该研究为南极真菌资源库提供重要数据,对极地微生物生态学和生物技术开发具有积极意义。

  
在地球最南端的冰雪大陆上,存在着一个生命极限的天然实验室——南极洲。这里常年被冰雪覆盖,平均温度低至零下数十摄氏度,强烈的紫外线辐射、贫瘠的营养环境和反复的冻融循环构成了极端严酷的生存条件。然而,就在这片看似荒芜的白色荒漠中,却隐藏着令人惊叹的生命奇迹。特别是在仅占南极总面积不到0.5%的无冰区,这些在夏季短暂裸露的"生命绿洲"成为了南极生物多样性的热点区域。
随着全球气候变暖的持续影响,南极半岛地区正经历着显著的环境变化,气温上升和降水增加导致无冰区面积不断扩大,这为更多生物的生存和繁衍创造了新的生态位。其中,微生物作为南极生态系统中的重要组成部分,在营养循环和能量流动中扮演着关键角色。而真菌作为微生物群落中多样性最丰富的类群,它们通过腐生、共生和寄生等多种生活方式,在南极生态系统中形成了复杂的生态网络。
尽管南极真菌研究已经取得了一定进展,但我们对这一极端环境下真菌多样性、分布规律及其生态功能的认知仍然十分有限。传统的形态学鉴定方法由于真菌在极端环境下可能丢失某些形态特征,且很少产生有性孢子,使得准确鉴定变得困难重重。西格尼岛作为南极海洋性气候区的典型代表,其相对温和的气候条件支持了较为丰富的植被生长,特别是苔藓植物能够形成大面积的垫状群落,为真菌提供了独特的微生境。然而,对该岛屿真菌群落的系统研究仍显不足,这限制了我们全面理解南极真菌的分布格局和生态适应机制。
为了解决这一科学问题,马来西亚理科大学的研究团队开展了对西格尼岛土壤和苔藓样品中真菌的分子鉴定研究。研究人员采用现代分子生物学技术,通过对核糖体内部转录间隔区(ITS)的序列分析,旨在准确揭示该地区真菌的物种组成和多样性特征,为南极真菌资源库提供新的数据支持,同时为理解真菌在极端环境下的适应机制奠定基础。
研究团队主要运用了以下关键技术方法:从16个采样点收集20份土壤和苔藓样本后,通过稀释涂布法和组织分离法进行真菌分离培养,使用马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)培养基在15°C和25°C条件下进行培养;提取纯培养菌株的基因组DNA后,利用ITS1和ITS4引物对ITS区域进行PCR扩增;将扩增产物测序后,通过BLASTn比对NCBI数据库进行分子鉴定,并采用最大似然法构建系统发育树分析菌株亲缘关系。
研究结果
真菌多样性组成
通过ITS rDNA基因序列分析,研究成功从西格尼岛的样品中获得了61株真菌分离物。分子鉴定结果显示,这些真菌都属于子囊菌门(Ascomycota),可进一步划分为三个纲:散囊菌纲(Eurotiomycetes)、粪壳菌纲(Sordariomycetes)和座囊菌纲(Dothideomycetes)。其中优势菌种为橘青霉(Penicillium citrinum),占总分离物的47.54%,其次为藤仓赤霉(Fusarium fujikuroi)(29.50%)和层出镰刀菌(Fusarium proliferatum)(8.20%)。其他菌种包括草本茎点霉(Phoma herbarum)(4.92%)、黑曲霉(Aspergillus niger)(3.28%),以及波兰青霉(Penicillium polonicum)、链格孢(Alternaria alternata)、丹尼奎拉塔菌(Deniquelata barrigtoniae)和绿生丽赤壳菌(Cosmospora viridescens),各占1.64%。
基质特异性分布
研究还分析了不同基质中真菌的分布差异。从土壤样品中分离到的37株真菌包括橘青霉(25株)、黑曲霉(2株)、藤仓赤霉(11株)、层出镰刀菌(4株)、草本茎点霉(3株)和链格孢(1株)。而在苔藓样品中获得的24株真菌包括橘青霉(4株)、波兰青霉(1株)、藤仓赤霉(7株)、层出镰刀菌(1株)、丹尼奎拉塔菌(1株)和绿生丽赤壳菌(1株)。这一分布模式表明,不同基质为真菌生长提供了不同的微环境,从而影响了真菌群落的组成。
系统发育分析
通过最大似然法构建的系统发育树显示,西格尼岛的真菌分离物与来自世界不同地区的参考菌株具有高度的序列相似性。特别是橘青霉和藤仓赤霉等优势菌种,与温带甚至热带地区的菌株聚在同一进化支上,这表明这些真菌具有广泛的分布范围和较强的环境适应能力。系统发育分析结果为理解南极真菌的生物地理分布和进化历史提供了重要线索。
讨论与结论
本研究通过分子鉴定方法,成功揭示了西格尼岛土壤和苔藓中的真菌多样性特征。研究结果与先前在南极其他地区的发现相一致,都表明子囊菌门是南极真菌群落中的优势类群。青霉属(Penicillium)、镰刀菌属(Fusarium)和曲霉属(Aspergillus)等属的普遍存在,证实了这些 cosmopolitan 真菌分类群在南极极端环境中的生态优势和广泛适应性。
值得注意的是,苔藓作为南极植被的重要组成部分,为真菌提供了相对稳定的微环境条件,包括保湿性、有机质来源和缓冲极端环境波动的作用。这与先前在维多利亚地和国王乔治岛的研究结果相呼应,都表明苔藓是南极真菌多样性的重要储存库。特别是绿生丽赤壳菌(Cosmospora viridescens)在苔藓中的发现,进一步证实了苔藓微生境对特殊真菌类群的庇护作用。
从方法论角度看,本研究充分展示了分子技术在极端环境微生物研究中的优势。ITS区域作为真菌的DNA条形码,能够有效解决形态鉴定中的困难,特别是在处理那些不产生明显形态特征或只存在无性阶段的真菌时表现出色。分子技术的应用不仅提高了物种鉴定的准确性,还为进一步研究真菌的生态功能、适应机制和生物技术潜力奠定了基础。
这项研究的发现对多个领域具有重要意义。在生态学层面,它为理解南极真菌多样性分布格局和群落构建机制提供了新的数据支持,有助于预测气候变化背景下南极生态系统的响应模式。在生物技术领域,南极真菌作为极端环境适应的代表,其独特的代谢途径和应激耐受机制可能产生具有应用价值的生物活性物质,如冷适应酶、抗菌代谢产物等。此外,研究结果还为南极微生物资源保护和可持续利用提供了科学依据。
随着分子技术的不断进步和测序成本的降低,未来对南极真菌的研究将更加深入和系统。结合宏基因组学、转录组学和代谢组学等多组学方法,将能够全面揭示南极真菌的多样性、生态功能及其在极端环境下的适应机制。西格尼岛作为南极海洋性气候区的典型代表,其真菌研究将继续为理解极地生态系统和全球变化影响提供重要窗口。
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