基于频域伪标签动态混合监督和部分Dice约束的弱半监督心脏MRI分割方法

《Neural Networks》:Weakly Semi-Supervised Cardiac MRI Segmentation with Frequency-Domain Pseudo Label Dynamic Mixed Supervision and Partial-Dice Constraints

【字体: 时间:2025年11月27日 来源:Neural Networks 6.3

编辑推荐:

  针对心脏MRI自动分割中标注数据依赖过高的难题,提出PDFMSeg框架,结合频率域动态混合监督和部分Dice损失,有效减少标注需求并提升分割精度。实验表明在ACDC和MSCMR数据集上DSC、JC和HD95指标优于现有弱半监督方法,参数量仅1.82M,计算效率高。

  
心血管疾病(CVDs)作为全球主要死亡原因,其诊断效率与准确性直接影响患者生存质量。磁共振成像(MRI)凭借无创性、高分辨率和软组织对比优势,已成为心脏结构评估的核心手段。然而传统人工分割耗时且误差率高,亟需智能化解决方案。当前深度学习分割方法主要分为三类:完全监督式(依赖精细标注)、无监督式(性能受限)和弱监督半自动式(标注量少但效果稳定)。其中弱监督方法因符合实际标注资源稀缺的现状,成为近年研究热点。

在弱监督框架下,现有方法主要围绕伪标签生成与监督策略展开创新。伪标签生成通常采用超像素分割结合 scribble 标记(如Li等2024),或基于多分支网络预测融合(如Wang等2023)。但这类方法存在明显局限:首先,超像素分割易产生伪标签边缘模糊问题,导致区域监督失效;其次,多分支预测虽能提升伪标签质量,但随机权重混合策略(如Zhang等2025a)难以有效抑制高频噪声干扰。其次, scribble 监督普遍采用交叉熵损失,存在背景噪声干扰和梯度震荡问题。例如现有方法对非 scribble 区域的无效监督会消耗计算资源,同时梯度震荡易导致训练不稳定。

针对上述痛点,研究团队提出 PDFMSeg 算法,其创新性体现在两个核心维度:第一,构建频率域动态混合监督机制(FPLMS),通过 Haar 小波变换将伪标签分解为高频和低频分量,分别采用独立优化策略。高频部分聚焦边缘特征提取,低频部分强化区域轮廓建模,这种频域分离机制有效解决了传统混合方法(如PLMS)中高频噪声累积问题。实验数据显示,该方法在HD95指标上较PLMS提升12.4%,尤其在室间隔等精细结构分割中优势显著。

第二,研发部分Dice损失(L_pDice)优化 scribble 监督。传统 scribble 方法仅考虑 scribble 区域的交叉熵损失,导致背景区域干扰和边缘模糊问题。新设计的L_pDice通过三重机制突破瓶颈:首先引入忽略掩膜(ignore mask),自动过滤非 scribble 区域的无效反馈;其次采用 log-cosh 损失函数替代传统平方损失,在梯度计算中引入双曲余弦函数,有效抑制梯度震荡导致的震荡分割现象;最后设计动态权重衰减机制,当 scribble 区域置信度低于阈值时自动触发权重衰减,避免过度拟合伪标签噪声。

实验验证部分采用ACDC和MSCMR两大权威心脏MRI数据集。ACDC包含100例双期(舒张/收缩期)MRI影像,标注涵盖左心室、右心室和心肌组织。MSCMR数据集则包含686例增强MRI切片,重点测试算法在低标注场景下的泛化能力。研究采用10%标注率作为基准测试,结果显示PDFMSeg在DSC(83.57%)和HD95(31.66%)指标上均显著优于当前主流方法。特别值得注意的是,在MSCMR数据集上,PDFMSeg的HD95指标达到31.66%,较次优方法提升17.3%,这得益于FPLMS对高频噪声的有效抑制。

算法效率方面,PDFMSeg采用四分支CNN-ViT架构,在保持模型性能的同时将参数量压缩至1.82M,计算量控制在2.32G FLOPs。这种高效设计使算法能够部署于医疗机构的GPU集群或移动端设备,满足实时诊断需求。消融实验进一步证明,FPLMS模块单独运行时DSC指标仅为75.2%,而L_pDice模块在基础网络上的增益达8.7%。两者协同作用产生显著乘数效应,验证了混合监督策略的有效性。

临床应用价值体现在两个关键改进:首先,通过高频/低频分离处理,算法在心脏瓣膜等精细结构分割中表现出色。其次,动态忽略掩膜机制可自动识别不同数据源中的标注噪声,例如在MSCMR数据集中,部分伪标签存在边缘抖动问题,系统可自动降低此类区域的监督权重,避免误导模型。这种鲁棒性使得PDFMSeg在标注质量参差的情况下仍能保持稳定输出。

方法学创新点包括:1)提出频域动态混合机制,通过小波变换实现特征解耦与重组;2)设计可学习的伪标签置信度评估模块,动态调整各分支权重;3)开发新型部分Dice损失函数,融合忽略掩膜和梯度稳定技术。其中FPLMS模块采用双通道处理策略:低频通道通过全连接层融合多分支预测结果,强化区域一致性;高频通道则采用边缘增强滤波器组,提升边界清晰度。这种频域分离机制突破了传统像素级混合的局限性,在保证模型可更新性的同时提升边界约束能力。

实验对比显示,PDFMSeg在10%标注率下表现优于当前主流方法。例如在ACDC数据集上,其DSC值较S3D+伪标签方法提升8.9%,较UNet++(多分支预测)方法提升7.3%。这主要归因于两点突破:其一,通过小波变换分离高频噪声,使伪标签边界准确度提升12%;其二,部分Dice损失函数在 scribble 区域的监督强度提升40%,同时背景干扰降低65%。在MSCMR数据集上的测试进一步验证了算法的泛化能力,DSC值达到74.29%,显著高于PLMS方法(68.14%)。

算法优势还体现在计算效率上。四分支架构通过特征复用机制,将参数量控制在1.8M以内,较同类方法减少30%参数量。动态混合策略使训练迭代次数减少25%,FLOPs指标控制在2.32G,完全符合医疗影像系统对实时性和资源消耗的严格要求。特别值得关注的是,算法在标注噪声存在时仍能保持稳定,如在MSCMR数据集中,约15%伪标签存在边缘偏差,但PDFMSeg通过置信度评估模块自动降低此类区域的监督权重,最终HD95指标仍达31.66%。

临床转化潜力方面,算法支持在线标注更新机制。在实际应用中,医生仅需标记关键兴趣区域(如心脏瓣膜或血栓部位),系统自动生成伪标签并动态优化。测试数据显示,在初始10%标注基础上,经过3轮迭代(每轮标注新增5%数据),模型DSC值可提升至82.3%,验证了算法的持续学习能力。此外,开源代码平台已部署自动化标注辅助工具,可将专家标注效率提升3倍,这对解决医疗标注资源短缺问题具有重要实践价值。

未来研究方向包括:1)开发轻量化版本以适应移动设备部署;2)探索跨模态数据融合,整合CT和超声影像信息;3)构建动态标注反馈系统,实现临床诊断与算法迭代的闭环优化。当前研究已通过Nantong科技专项资助,计划在三级医院开展多中心临床试验,验证算法在真实场景中的临床价值。

该研究为心脏MRI自动分割提供了创新解决方案,其核心突破在于将信号处理领域的频域分析方法引入监督学习框架。通过将小波变换与深度学习监督机制结合,既解决了伪标签噪声问题,又提升了边缘分割精度。这种跨学科方法创新为医学影像分析开辟了新路径,对推动精准医疗发展具有重要学术价值和社会意义。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号