极长链脂肪酸驱动1-脱氧鞘脂毒性的分子机制揭示:靶向ELOVL1作为治疗新策略

《Nature Communications》:Very long-chain fatty acids drive 1-deoxySphingolipid toxicity

【字体: 时间:2025年11月27日 来源:Nature Communications 15.7

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  本研究聚焦于1-脱氧鞘脂(1-deoxySLs)毒性机制不清的难题。研究人员通过CRISPRi筛选、功能脂质组学及药理学干预,系统阐明了极长链(VLC)1-脱氧二氢神经酰胺(特别是m18:0/24:1)是核心毒性介质,其通过诱导线粒体通透性转换孔(mPTP)开放和BAX激活导致细胞死亡。研究证实抑制脂肪酸延长酶ELOVL1可有效阻断毒性脂质生成,为遗传性感觉神经病1型(HSAN1)和糖尿病神经病变等疾病提供了新的治疗靶点。

  
在生命科学的精密网络中,鞘脂(Sphingolipids, SL)作为一类具有重要生物活性的脂质分子,扮演着维持细胞结构、信号传导和能量代谢等多重关键角色。然而,当鞘脂的正常合成途径出现“偏差”时,便可能产生具有细胞毒性的“异常分子”,其中1-脱氧鞘脂(1-deoxysphingolipids, 1-deoxySLs)便是这样一个令人瞩目的焦点。1-脱氧鞘脂的产生源于丝氨酸棕榈酰转移酶(Serine Palmitoyltransferase, SPT)在催化起始反应时,错误地利用了L-丙氨酸(L-alanine)而非L-丝氨酸(L-serine)作为底物。这一微小的底物替换,导致生成的鞘氨醇碱基(Long-Chain Base, LCB)在C1位置缺少了一个至关重要的羟基,从而使其成为一类无法通过经典途径进一步代谢或降解的“孤儿脂质”。
病理状态下,1-脱氧鞘脂的异常积累与多种神经系统疾病密切相关,其中最典型的是遗传性感觉自主神经病1型(Hereditary Sensory and Autonomic Neuropathy Type 1, HSAN1)和糖尿病神经病变(Diabetic Neuropathy)。患者常表现为进行性的感觉丧失,尤其是痛温觉障碍,严重影响了生活质量。尽管临床关联明确,但1-脱氧鞘脂究竟通过何种分子机制对细胞(尤其是神经元)施加毒性作用,长期以来一直是一个悬而未解的谜团。是游离的1-脱氧鞘氨醇(1-deoxysphinganine, 1-deoxySa)本身有毒,还是其后续代谢产物是元凶?毒性是否与脂质分子上连接的脂肪酸链长度有关?这些问题亟待解答。为了解决这些关键科学问题,由Adam Majcher和Thorsten Hornemann等人组成的研究团队开展了一项系统性的研究,其成果最终发表在顶级学术期刊《Nature Communications》上。
本研究综合运用了多种关键技术方法。研究人员首先利用全基因组CRISPR干扰(CRISPR interference, CRISPRi)筛选技术,在K562细胞模型中系统寻找调控1-deoxySL毒性的关键基因。在此基础上,通过稳定同位素(如d3-1-deoxySa)标记的代谢流分析(isotopic flux assay)结合高分辨率液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)脂质组学,精确追踪了1-deoxySL在细胞内的代谢命运。功能验证方面,研究采用了小干扰RNA(siRNA)敲低和CRISPR-Cas9基因敲除技术,在HeLa细胞中特异性沉默或敲除候选基因(如ELOVL1, CERS2)。药理学实验中,使用了临床前验证的ELOVL1小分子抑制剂Compound 22。此外,研究还利用鸡胚背根神经节(Dorsal Root Ganglion, DRG)原代神经元模型评估神经毒性,并通过线粒体功能分析(如Seahorse能量代谢分析仪)、线粒体肿胀实验等,深入探究了毒性作用的细胞器水平机制。
1-deoxyDHCeramides are the primary mediators of 1-deoxySphingolipids induced toxicity
为了确定1-deoxySL毒性的直接介质,研究人员首先使用了已知的神经酰胺合成酶(Ceramide Synthase, CERS)抑制剂伏马菌素B1(Fumonisin B1, FB1)。结果证实,FB1能显著缓解1-deoxySa诱导的细胞毒性。进一步的代谢流分析显示,FB1处理导致游离的1-deoxySa和1-deoxySo积累,同时抑制了N-酰化产物(如1-deoxyDHCer和1-deoxyCer)的生成,提示毒性可能源于后者。接着,团队比较了饱和的1-deoxySa和其不饱和类似物1-deoxySo(由脂肪酸脱饱和酶3, FADS3催化生成)的毒性,发现1-deoxySa的毒性远高于1-deoxySo。脂质组学分析表明,1-deoxySa主要转化为1-deoxyDHCer和1-deoxyCer,而1-deoxySo则几乎只生成1-deoxyCer。这些数据共同表明,饱和的N-酰化产物,特别是1-deoxyDHCer,是1-deoxySL细胞毒性的主要介质。
CRISPRi toxicity screen identifies gene candidates responsible for 1-deoxySphingolipids toxicity
为了系统性筛选与1-deoxySL毒性相关的基因,研究团队在K562细胞中进行了全基因组CRISPRi毒性筛选。筛选结果鉴定出5个基因的敲低能显著增强细胞对1-deoxySa的耐受性。这些基因均与脂肪酸延长或鞘脂合成密切相关,包括:ELOVL1(极长链脂肪酸延长酶1)、HSD17B12、ACACA、PTPLB和CERS2(神经酰胺合成酶2,偏好利用极长链脂肪酸)。值得注意的是,ELOVL1负责将酰基辅酶A延长为极长链脂肪酸(如C24:0, C24:1),这些脂肪酸正是CERS2的底物,用于合成极长链1-deoxyDHCer。相反,FADS3被鉴定为敏感基因,其敲低加剧毒性,这与FADS3催化生成低毒性不饱和1-deoxySo的保护作用一致。基因集富集分析进一步证实,脂肪酸延长和生物合成通路在介导毒性中扮演核心角色。
Silencing of ELOVL1 and CERS2 expression confirms their role in 1-deoxysphingolipid mediated toxicity
基于筛选结果,研究人员对ELOVL1和CERS2进行了深入的功能验证。在HeLa细胞中,通过siRNA敲低或CRISPR-Cas9敲除ELOVL1,均导致代谢流从极长链1-deoxyDHCer(如m18:0/24:0和m18:0/24:1)向长链1-deoxyDHCer(如m18:0/16:0, m18:0/18:0)转移,并显著缓解了1-deoxySa的毒性。同样,敲除CERS2(偏好极长链底物)也降低了极长链1-deoxyDHCer水平并产生保护效应,而敲除偏好长链底物的CERS5/6则对毒性影响甚微。这些结果确证了ELOVL1和CERS2是通过合成极长链1-deoxyDHCer来驱动1-deoxySL毒性的关键酶。
Pharmacological inhibition of ELOVL1 mitigates 1-deoxysphingolipids induced mitochondrial and neuronal toxicity
鉴于遗传学干预的有效性,研究团队进一步探索了药理学抑制ELOVL1的治疗潜力。他们使用了先前为治疗X-连锁肾上腺脑白质营养不良症(X-linked adrenoleukodystrophy, X-ALD)而开发的ELOVL1小分子抑制剂Compound 22。在HeLa细胞中,Compound 22处理成功模拟了遗传学干预的效果,即减少极长链1-deoxyDHCer生成,增加长链1-deoxyDHCer,并有效抵抗了1-deoxySa的毒性。更重要的是,Compound 22能够完全逆转1-deoxySa引起的线粒体呼吸功能和糖酵解能力损伤。在生理相关性更强的鸡胚背根神经节(DRG)原代神经元模型中,Compound 22同样显示出代谢活性,能改变DRG中的1-deoxySL谱系,并显著挽救1-deoxySa引起的神经元轴突退化,证明了其神经保护作用。
Nervonyl-1-deoxyDHCeramide(m18:0/24:1) is the strongest inductor of mitochondrial damage and cellular toxicity
最后,研究旨在精确解析不同链长1-deoxyDHCer物种的毒性差异。通过在ELOVL1抑制剂(Compound 22)存在下分别补充棕榈酸(16:0)、木蜡酸(24:0)和神经酸(24:1),研究人员能够特异性地诱导细胞产生相应链长的1-deoxyDHCer。毒性实验表明,源自神经酸(24:1)的神经酰-1-脱氧二氢神经酰胺(nervonyl-1-deoxyDHCer, m18:0/24:1)毒性最强,其次为m18:0/24:0和m18:0/16:0。在线粒体水平,直接使用合成的脂质分子处理分离的小鼠肝脏线粒体,发现m18:0/24:1能引起最显著的线粒体肿胀,这是线粒体通透性转换孔(mitochondrial Permeability Transition Pore, mPTP)开放的标志。mPTP抑制剂环孢素A(Cyclosporin A, CsA)可以抑制这种肿胀。在细胞实验中,CsA和BAX(促凋亡蛋白)抑制剂肽V5均能保护细胞免受1-deoxySa诱导的死亡。这些结果揭示了1-deoxySL,特别是m18:0/24:1,通过诱导线粒体mPTP开放和后续的BAX依赖性凋亡信号通路,从而导致细胞死亡的全新分子机制。
综上所述,这项研究首次清晰地阐明了1-脱氧鞘脂毒性的分子路径:极长链脂肪酸(特别是C24:1)通过ELOVL1和CERS2的级联反应,被整合到1-脱氧鞘氨醇碱基上,形成高毒性的1-deoxyDHCer(主要是m18:0/24:1);该脂质分子直接靶向并破坏线粒体膜稳定性,引发mPTP开放和BAX介导的细胞凋亡。这项工作的意义重大,它不仅解答了该领域长期存在的核心问题,将1-deoxySL的化学结构(碱基饱和度、N-酰基链长度和饱和度)与其细胞毒性直接联系起来,更重要的是,它提出了靶向脂肪酸延长酶ELOVL1作为一种全新的、具有转化医学潜力的治疗策略,为HSAN1、糖尿病神经病变等由1-deoxySL积累引起的疾病提供了新的希望和干预方向。
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