转录组揭示了中国软壳龟（Pelodiscus sinensis）肠道对嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）感染的分子反应

《Aquaculture International》：Transcriptome reveals the molecular response of the Chinese soft-shelled turtle (Pelodiscus sinensis) intestine to Aeromonas hydrophila infection

　　中国软体龟肠道受 Aeromonas hydrophila 感染后，转录组分析显示肠道 villi 萎缩、凋亡细胞增多，183 个基因上调（免疫、凋亡相关）及 162 个基因下调（上皮完整性、消化相关），GO富集涉及生物刺激响应、细胞粘附等，KEGG 通路包括紧密连接、代谢等，揭示感染引发免疫、屏障及代谢显著改变。

　　

摘要

中华软壳龟（Pelodiscus sinensis）是中国具有重要商业价值的水产养殖物种。肠道是消化和吸收营养的主要器官，同时也是抵御有害外来物质的重要屏障。Aeromonas hydrophila是一种常见的水产养殖病原菌，可导致P. sinensis患上多种疾病，从而引发代谢紊乱和器官组织损伤。在本研究中，我们探讨了A. hydrophila感染引起的P. sinensis肠道损伤的转录反应。结果表明，感染导致严重的形态学损伤，包括肠道绒毛萎缩以及前肠部分绒毛高度、宽度和隐窝深度的显著降低。TUNEL染色显示，感染组中的晚期凋亡细胞数量明显高于对照组。此外，A. hydrophila感染显著上调了促凋亡基因的表达。转录组分析发现，在A. hydrophila感染后，P. sinensis肠道中有345个显著的差异表达基因（183个上调，162个下调）。其中，与免疫和凋亡相关的基因上调显著，而与上皮完整性和消化相关的基因则显著下调。GO富集分析揭示了与生物刺激响应、细胞黏附和细胞骨架组织相关的显著术语，KEGG分析则指出紧密连接、糖胺聚糖降解、代谢途径和溶酶体是最显著的富集核心通路。这些结果共同表明，在细菌感染期间，免疫反应、屏障功能和代谢稳态发生了显著变化。