胶质母细胞瘤中miR-205-5p低表达与circ_100290高表达协同促进肿瘤侵袭性的机制研究
《Hormones & Cancer》:MiR-205-5p downregulation and circ_100290 upregulation in glioblastoma patients are associated with tumor aggressiveness
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时间:2025年11月30日
来源:Hormones & Cancer
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本研究聚焦胶质母细胞瘤(GBM)诊断与治疗难题,探讨非编码RNA分子标志物的作用。研究人员通过生物信息学分析与实验验证,发现miR-205-5p显著下调而circ_100290明显上调,且表达水平与肿瘤体积、脑叶定位及IDH1突变等临床特征显著相关。该研究揭示了二者通过调控Wnt等关键信号通路影响GBM进展,为开发新型诊疗策略提供了重要理论依据。
胶质母细胞瘤(Glioblastoma Multiforme, GBM)作为最具侵袭性的原发性脑肿瘤,占所有脑肿瘤的近50%,其诊断困难、治疗抵抗性强,患者预后极差。当前标准疗法包括手术联合放化疗,但疗效有限,五年生存率不足10%。面对这一严峻挑战,科学家们将目光投向非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)领域,试图从基因调控层面寻找新的突破点。在众多ncRNA中,环状RNA(circular RNA, circRNA)和微RNA(microRNA, miRNA)因其稳定性和调控功能成为研究热点,尤其在肿瘤发生发展中的作用日益受到关注。其中,hsa_circ_100290和hsa-miR-205-5p在多种癌症中已被证实参与肿瘤进程,但它们在GBM中的具体角色及相互作用机制尚不明确,这正是本研究的出发点。
为深入探究这一问题,研究人员开展了一项整合生物信息学分析与实验验证的系统研究。首先利用公共基因表达数据库(GEO)筛选GBM相关数据集,预测分子互作网络;随后收集临床样本,通过实时定量PCR(qRT-PCR)技术检测目标分子表达水平,并分析其与患者临床病理特征的相关性。
研究主要采用以下关键技术方法:1)基于GEO数据库(GSE90603、GSE146463)的生物信息学分析,筛选差异表达的ncRNA并预测其靶基因与互作网络;2)利用miRDIP、CircInteractome等平台预测miR-205-5p靶基因及circ_100290结合蛋白;3)通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,Cytoscape软件可视化ceRNA网络,Enrichr进行通路富集分析;4)收集20例GBM患者肿瘤与正常组织FFPE样本,提取RNA后采用TaqMan探针法与SYBR Green法进行qRT-PCR验证;5)结合临床数据(如肿瘤大小、IDH1突变状态等)进行统计学分析,评估分子表达与疾病特征的关联性。
3.1 基于GEO数据集的miR-205-5p和circ_100290表达水平
生物信息学分析显示,circ_100290在GBM样本中表达显著上调(P=0.007),而miR-205-5p虽略有升高但无统计学差异(P=0.241)。这一结果提示circ_100290可能作为GBM潜在致癌因子,而miR-205-5p的功能需进一步验证。
3.2 miR-205-5p和circ_100290的互作网络与通路分析
研究发现miR-205-5p与PTEN、SMAD4等关键肿瘤抑制因子相关,circ_100290则可结合EIF4A3、AGO2等RNA结合蛋白(RBP)。ceRNA网络分析表明,二者可能通过竞争性结合共同靶点调控Wnt/PI3K-Akt等信号通路,影响mRNA剪接、基因表达等生物学过程,进而参与GBM进展。
临床样本分析显示,miR-205-5p在GBM组织中显著下调(P=0.002),而circ_100290明显上调(P=0.026)。表达水平与肿瘤特征关联分析发现,miR-205-5p低表达与较大肿瘤体积(P=0.025)及特定脑叶定位(如颞叶、多脑叶)显著相关;circ_100290高表达则与IDH1突变状态密切关联(P=0.008)。
进一步分析揭示,左脑半球肿瘤中miR-205-5p表达高于右脑(P=0.005),而肿瘤尺寸大于5cm时其表达显著降低(P=0.031);IDH1突变型肿瘤中circ_100290表达明显高于野生型(P=0.036)。
本研究通过多维度分析证实,miR-205-5p在GBM中发挥肿瘤抑制作用,其低表达与肿瘤侵袭性增强相关;而circ_100290作为潜在致癌因子,上调可能促进IDH1突变相关肿瘤进程。二者通过ceRNA机制调控Wnt/PI3K-Akt等关键通路,影响GBM的增殖、侵袭及血管生成等恶性表型。尽管研究存在样本量有限、未直接验证下游效应分子等局限性,但首次揭示了miR-205-5p与circ_100290在GBM中的协同调控网络,为开发基于ncRNA的诊疗策略提供了新靶点。未来研究可扩大样本规模、结合功能实验深入探讨其分子机制,推动GBM精准医疗发展。
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