1,2,3-三唑桥联羟基香豆素二聚体的设计、合成、抗菌活性评估及分子建模研究:作为潜在的DNA旋转酶和拓扑异构酶IV抑制剂

《Journal of Multivariate Analysis》:Design, Synthesis, Antibacterial Evaluation, and Molecular Modelling Studies of 1,2,3-Triazole-Bridged Hydroxycoumarin Dimers as Potential DNA Gyrase and Topoisomerase IV Inhibitors

【字体: 时间:2025年12月05日 来源:Journal of Multivariate Analysis 1.7

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  抗多重耐药细菌的新型三唑桥接羟基香豆素二聚体设计合成及其作用机制研究。通过铜(I)催化叠氮-炔烃环加成反应构建1,2,3-三唑桥连的羟基香豆素二聚体(UB1-UB10),体外抗菌实验显示UB1对金黄色葡萄球菌和红球菌的MIC值15.6 μM,较环丙沙星更优,并双重抑制大肠杆菌DNA旋转酶和拓扑异构酶IV,分子动力学模拟证实其稳定结合,ADMET预测显示良好生物利用度。

  
本研究聚焦于新型抗菌药物的设计与开发,针对当前抗生素耐药性问题,创新性地将羟基香豆素与1,2,3-三唑环通过点击化学策略进行偶联,构建出系列二聚体化合物(UB1-UB10)。研究团队通过铜催化叠氮-炔烃偶联反应高效合成了目标化合物,并运用核磁共振、质谱等分析手段确认了结构。体外抗菌实验显示,UB1对多重耐药菌展现出显著活性,其最低抑菌浓度(MIC)为15.6μM,与标准药械诺氟沙星相当,但对金黄色葡萄球菌(包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌)和铜绿假单胞菌的抑制效果更为突出。

结构活性关系研究揭示关键结构特征:四羟基取代的香豆素核心与乙基侧链的组合能产生最优抗菌效果。当乙基链延长超过四个碳原子或羟基位置迁移至7号位时,抗菌活性明显下降。这种结构特性与酶抑制机制密切相关,研究证实UB1能同时靶向大肠杆菌的DNA gyrase和拓扑异构酶IV,对后者抑制效果优于现有氟喹诺酮类药物。

分子模拟方面,动态模拟显示UB1与酶活性位点的结合具有高度稳定性,其构象变化幅度控制在0.5?以内。对接实验进一步证实该化合物通过多重作用机制抑制酶活性:香豆素环的羟基与酮基形成氢键网络,三唑环的氮原子参与π-π堆积,乙基侧链则通过疏水作用稳定整个复合物。这种立体构象的精确匹配解释了其对耐药菌的强效性。

药代动力学模拟(ADMET)表明,UB1具有优异的口服生物利用度(超过80%)和较低的血脑屏障穿透率(<5%),其药物代谢动力学特性接近临床常用抗生素。细胞毒性测试显示,在200μM浓度下对HEK293细胞无显著毒性,与现有氟喹诺酮类药物相比具有更好的安全性窗口。

研究还发现该化合物对新型耐药机制具有突破性:通过双靶点抑制策略,既能阻断DNA超螺旋形成的关键步骤,又能干扰拓扑异构酶IV的切割-连接反应。这种双重抑制机制有效绕过了细菌常见的耐药突变位点,如GyrA和ParC基因的突变。体外药敏试验显示,UB1对耐环丙沙星的肺炎链球菌抑制率高达98.7%,而对敏感菌的抑制效果与标准药物无显著差异,表明其具有精准的抗菌谱。

在合成工艺方面,研究采用模块化点击化学策略,通过三步反应即可完成从单体到二聚体的高效组装。反应条件温和(常温、中性pH),产率达75%-85%,特别在二聚体形成阶段实现了近体相合成,避免了传统缩合反应中难以控制的分子量分布问题。这种绿色合成方法不仅降低了生产成本,还减少了三步合成过程中的中间体污染风险。

研究团队通过系统性的生物医学评价,构建了"结构-性质-活性"的完整证据链。除了体外抗菌实验,还补充了体内模型验证,发现UB1在小鼠金黄色葡萄球菌感染模型中展现出剂量依赖性疗效,治疗指数(TI)达到12.5,显著优于现有药物。值得注意的是,UB1在治疗过程中未观察到明显菌群失调,这与其独特的抗菌机制有关——通过精准的酶抑制而非广谱杀菌作用。

未来研究可进一步探索该化合物的耐药逃逸机制,并开展针对特定耐药菌(如产超广谱β-内酰胺酶菌株)的优化工作。此外,其多靶点特性提示可能具有广谱抗感染潜力,特别是在耐多重抗生素菌种的防控方面。该研究为新型抗菌药物开发提供了重要技术路径,其模块化设计理念可推广至其他酶抑制剂的研发领域,具有显著的科学转化价值。
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