候选预后长链非编码RNA（lncRNAs），包括C2orf49-DT、CAPN10-DT和LOC105371795，作为结直肠癌的潜在生物标志物

《Biochemical Genetics》：Candidate Prognostic LncRNAs Including C2orf49-DT, CAPN10-DT, LOC105371795 as Potential Biomarkers for Colorectal Cancer

　　长非编码RNA（lncRNA）作为结直肠癌（CRC）的潜在生物标志物，其表达水平与患者预后及细胞增殖通路相关。本研究通过TCGA数据挖掘和伊朗肿瘤银行样本验证，发现C2orf49-DT、CAPN10-DT和LOC105371795在CRC组织中显著高表达，并与E2F3等促增殖基因共表达，且与患者不良预后显著相关。qRT-PCR验证了这三类lncRNA在肿瘤组织中的表达差异，提示其作为CRC诊断和预后预测的生物标志物价值。

　　

摘要

长链非编码RNA（lncRNAs）具有调控功能，并与多种疾病相关，包括癌症。在这项研究中，我们探讨了可能与结直肠癌（CRC）发病机制相关的特征性lncRNAs，这些lncRNAs可以作为诊断和预后生物标志物。我们利用癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）的数据，分析了lncRNA表达与患者死亡率之间的关系。随后，通过线性模型确定了癌症样本和健康样本中lncRNAs的差异表达。通过Cox回归测试研究了lncRNA表达与患者预后的关联，并利用一部分lncRNAs构建了风险模型。进一步分析了共表达网络，以识别与候选lncRNAs相关的通路。为了验证计算机模拟分析的结果，我们在伊朗肿瘤库（Iranian Tumor Bank）的35个肿瘤样本中检测了特定lncRNAs的表达水平。使用Trizol提取RNA并评估了其质量。cDNA合成后，通过qRT-PCR方法测定了候选基因的表达水平。研究结果表明，C2orf49-DT、CAPN10-DT和LOC105371795在CRC样本中的表达水平较高，且与预后较差的患者相关。共表达网络数据分析显示，这些lncRNAs与参与细胞增殖的关键基因（如E2F3）存在关联。RT-qPCR结果显示，与健康组织样本相比，C2orf49-DT、CAPN10-DT和LOC105371795在CRC样本中的表达显著增加。我们在体外数据中也发现了这些lncRNAs表达水平与E2F3表达之间的显著相关性。我们的研究结果表明，C2orf49-DT、CAPN10-DT和LOC105371795水平的升高可能与CRC患者的死亡率增加有关。这些非编码RNA与促进细胞增殖的通路相关，因此被提议作为诊断和预测CRC的潜在生物标志物。

图形摘要