摘要A002：肺癌前病变中的原位KRAS基因定位及空间组学特征分析 免费

《Cancer Research》：Abstract A002: In situ KRAS-mapping and spatial-omics characterization in lung premalignancy Free

　　本研究针对肺腺癌前恶性病变，采用BaseScope在位检测和空间质谱技术，发现代谢特征高度个体化，相同患者原位腺癌与浸润性腺癌基因表达相似，提示KRAS突变在早期进展中起关键作用。

　　

摘要

引言：

肺癌的症状通常在疾病晚期才会出现，导致诊断延误。这种延迟是肺癌预后较差的主要原因之一，也是肺癌成为全球癌症相关死亡首要原因的因素。目前对于肺癌的发生和发展机制仍缺乏基本的生物学理解。研究最终会发展成侵袭性癌的癌前病变有助于填补这一知识空白。我们专注于腺癌（AC），这是最常见的肺癌亚型，特别是关注Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因（KRAS）的激活突变，这是最常见的致癌突变之一，此前已在癌前肺病变中被发现。由于KRAS信号通路具有促进生长的作用，可以合理推测KRAS突变会促进肿瘤的形成和进展。然而，其影响的程度、突变发生的时间，以及其与驱动肿瘤演变的组织学和表型变化之间的具体联系仍不清楚。

方法：

我们收集了一组来自不同肿瘤发展阶段的腺癌患者的活检样本，部分样本还配备了“正常组织学”对照样本。共有38名腺癌患者的癌前病变组织可供研究。为了原位检测KRAS突变，我们使用了BaseScope检测技术，并配备了针对不同KRAS突变转录本的商用检测探针。为了将KRAS状态与微环境中的细胞表型联系起来，我们对部分患者使用了Bruker公司的CosMx平台上的6K发现面板进行单细胞分辨率的空间转录组学分析。同时，还对部分患者进行了Bruker公司的timsTOF flex MALDI-2设备上的空间质谱（MS）分析，以检测代谢特征。

结果：

初步的BaseScope检测结果显示，在癌前病变中可以检测到KRAS突变转录本的特异性信号，但灵敏度较低。而晚期癌症则显示出更明显的信号。这可能是因为在早期阶段KRAS的表达水平较低。为了解决这个问题，我们正在采用具有信号放大的BaseScope检测方法，以便能够检测到更低水平的KRAS表达。对空间质谱数据的初步分析显示，患者之间的代谢特征存在显著差异。这种差异也体现在批量RNA测序数据中，即同一患者的腺癌原位（AiS）和侵袭性腺癌样本之间的表达谱更为相似，而不同患者的AiS样本之间的表达谱差异较大。

结论：

通过将这种先进的多组学方法应用于腺癌的癌前病变，我们希望识别出早期肺癌进展的关键调控因子，并将这些发现转化为具有临床意义的基础分子诊断方法。

引用格式：

Amanda Lindberg, Bartosz Sobocki, Patrick Micke, Carina Strell. 原位KRAS基因映射和空间组学分析在肺癌癌前病变中的应用 [摘要]。载于：AACR癌症研究特别会议论文集：癌症进展与持续性的动态；2025年12月4-6日；新墨西哥州阿尔伯克基。费城（PA）：AACR；Cancer Res 2025;85(23_Suppl):Abstract nr A002。